R通过多列进行互相关

Question

我有这样的数据table：

> head(my_data)
     V1    V2    V3    V4    V5
1 36045 49933 41622 29491 34393
2 36874 44752 44158 40561 36045
3 45008 51964 58015 32733 29491
4 44830 72017 60434 40347 40561
5 48553 65470 49933 38842 32733
6 52028 64955 44752 41622 40347

我已经学会了如何通过多列查找相关性：

> head(cor(my_data)[,])
          V1        V2        V3        V4        V5
V1 1.0000000 0.4621777 0.7985130 0.9490929 0.9045297
V2 0.4621777 1.0000000 0.8041824 0.4201712 0.1583757
V3 0.7985130 0.8041824 1.0000000 0.7466672 0.5889458
V4 0.9490929 0.4201712 0.7466672 1.0000000 0.8672321
V5 0.9045297 0.1583757 0.5889458 0.8672321 1.0000000

我已经尝试了很多，但无法达到我的目标，即在每对中找到与 ccf 函数的互相关的最大绝对值。非常感谢您的所有回答！

Answer 1

mat
#         V1    V2    V3    V4    V5
# [1,] 36045 49933 41622 29491 34393
# [2,] 36874 44752 44158 40561 36045
# [3,] 45008 51964 58015 32733 29491
# [4,] 44830 72017 60434 40347 40561
# [5,] 48553 65470 49933 38842 32733
# [6,] 52028 64955 44752 41622 40347

class(mat)
# [1] "matrix"

combins <- combn(colnames(mat), 2)

a1 <- apply(combins, 2,
            FUN = function(x){ccf(mat[, x[1]], mat[, x[2]])})

abs_max_ccf <- unlist(lapply(a1, function(x) abs(max(x$acf))))

names(abs_max_ccf) <- apply(combins, 2, function(x) paste0(x[1], x[2], collapse = ''))

abs_max_ccf
#      V1V2      V1V3      V1V4      V1V5      V2V3      V2V4      V2V5      V3V4      V3V5      V4V5 
# 0.7460529 0.4450512 0.5167570 0.4672099 0.8028452 0.4944933 0.5220862 0.4076768 0.2884272 0.8494897

验证结果：从mat中提取两列：V1和V2并执行ccf的绝对最大值。

abs(max(ccf(mat[, "V1"], mat[, "V2"])$acf))
# [1] 0.7460529

R通过多列进行互相关

R Cross-correlation via multiple columns

math

r

correlation