Python：将pd.Series的所有组合写入文本文件

Question

我有几个 Pandas 系列独特的字符串：

    First Series
    P0A8V2
    P36683
    P15254

    Second Series
    P09831
    P0AFG8

我想编写一个如下所示的文本文件（制表符分隔符）：

P0A8V2 P36683
P0A8V2 P15254
P36683 P15254 
P09831 P0AFG8

所以在一个系列中，每个对象都与其他对象组合恰好一次。顺序无关紧要。然后下一个系列马上开始。

有简单的方法吗？

更新：

字符串在 DataFrame 的索引中。我使用 df.index.values 访问它们。 DataFrame 在 df_list.

中

def Cluster_Network(df_list):
    combi_list = []
    for cluster in df_list:
       combi_list.append(tuple(itertools.combinations(cluster.index.values, 2)))
    return combi_list

我得到了一个包含对的元组列表。

  [('P77717', 'P10378'),
  ('P18393', 'P77444'),
  ('P18393', 'P0AD44'),
  ('P18393', 'P10378'),
  ('P77444', 'P0AD44'),
  ('P77444', 'P10378'),
  ('P0AD44', 'P10378')),
 (('P77562', 'P41039'),)]

如何从该列表中写入文本文件？

Answer 1

看起来你快到了。

combi_list = []
for cluster in df_list:
    combi_list.append(pd.DataFrame(list(itertools.combinations(cluster.index, 2))))
result_df = pd.concat(combi_list, ignore_index=True)
result_df.to_csv(filename, sep='\t', index=False, header=False)

这将生成如下文件：

P0A8V2  P36683
P0A8V2  P15254
P36683  P15254
P09831  P0AFG8

Answer 2

另一种方法是使用将系列转换为列表，然后使用 itertools.combinations 获得所需的结果...像这样，

import pandas as pd
s1  = pd.Series(['a', 'b', 'c'])
s2  = pd.Series(['d', 'e'])

import itertools
s= s1.tolist()
s.extend(s2.tolist())
open('test.txt','w').writelines(["%s\t%s\n" % (item[0], item[1])  for item in list(itertools.combinations(s,2))])

Python：将pd.Series的所有组合写入文本文件

Python: Write all combinations of a pd.Series in a text file

python

combinations

pandas