当没有非 NA 值时,summarize 不会 return 来自 max 的警告

summarise does not return warning from max when no non-NA values

当调用 max(x, na.rm = TRUE) 时没有非 NA 值,它 returns -Inf,并带有警告。但是,在某些情况下,dplyr 中的 summarise 函数不会 return 警告:

library(magrittr)
library(dplyr)

df1 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(NA,NA))
df1 %>% group_by(a) %>% summarise(x = max(b, na.rm = TRUE))
# Three warnings, as expected.

df2 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(1,NA))
df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = max(b, na.rm = TRUE))
# No warning. Unexpected.

有趣的是,如果我重命名该函数,我会按预期收到警告:

# Pointer to same function.
stat <- max

df1 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(NA,NA))
df1 %>% group_by(a) %>% summarise(x = stat(b, na.rm = TRUE))
# Three warnings, as expected.

df2 <- data.frame(a = c("a","b"), b = c(1,NA))
df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = stat(b, na.rm = TRUE))
# Single warning, as expected.

其实我觉得应该是两个的警告,而不是三个,因为只有两组到summarise。但我不确定内部警告系统是如何工作的,所以可能是预期的三个警告。

我的问题是:为什么 summarise 在特定情况下不输出警告,如果这是预期的,为什么简单重命名函数会改变这种行为?

我的sessionInfo():

R version 3.3.2 (2016-10-31)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 14.04.5 LTS

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base

other attached packages:
[1] dplyr_0.5.0.9000 magrittr_1.5

loaded via a namespace (and not attached):
[1] lazyeval_0.2.0.9000 R6_2.2.0            assertthat_0.1
[4] tools_3.3.2         DBI_0.5-1           tibble_1.2
[7] Rcpp_0.12.8

虽然我使用的是dplyr的"dev"版本,但我也在CRAN可用的版本上进行了测试,结果相同。

以下为部分诊断;证明 dplyr 以某种方式弄乱了对函数名称 max() 的引用。此外,dplyr 通常在其 args 上使用 SE(标准评估):lazyeval::lazydots(..., .follow_symbols=F)),所以这可能会影响承诺,尽管我看不出如何:

A) group_by() 不是罪魁祸首。 df2 %>% group_by(a) %>% summarise(length(na.omit(b))) 确实证明组 b 正在将具有一个 NA 元素的向量传递给 max()

B) 当我们通过其限定名称 base::max 引用 max 时,我们会看到警告:

> df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = base::max(b, na.rm = TRUE))
       a     x
1      a     1
2      b  -Inf
Warning message:
In base::max(NA_real_, na.rm = TRUE) :
  no non-missing arguments to max; returning -Inf

而且我检查过没有 dplyr:::max(),所以它不是命名空间阴影。

B2) 同样,do.call(max, ...) 给出预期的警告。

> df2 %>% group_by(a) %>% summarise(x = do.call(max, list(b, na.rm = TRUE)))
       a     x
1      a     1
2      b  -Inf
Warning message:
In .Primitive("max")(NA_real_, na.rm = TRUE) :
  no non-missing arguments to max; returning -Inf

C) 另外,请注意 dplyr 通常在其 args 上使用 SE(标准评估):lazyeval::lazydots(..., .follow_symbols=F)),但我看不出这是怎么导致的。

C2) 我试图重新创建 group_by 的内部结果:

grouped_df(as.numeric(NA), list()), na.rm=T)

并用类似的东西重新创建承诺:

p <- lazyeval::lazy_dots( max, list( grouped_df(as.numeric(NA), list()), na.rm=T )  , .follow_symbols=F)

我无法用 .follow_symbols=T

来表达

我对标准评估几乎一无所知,所以在 http://adv-r.had.co.nz/Expressions.html#metaprogramming

继续侦查

使用的版本:dplyr 0.5.0; lazyeval 0.1.10 ;虽然 lazyeval 0.2.0 是 Hadley 的最新版本

对于 max(),可以使用混合版本,它对分组数据框的处理速度更快,因为整个评估可以在 C++ 中执行,而无需为每个组进行 R 回调。在dplyr 0.5.0中,当满足以下所有条件时触发混合版本:

  • 第一个参数指的是数据框中存在的变量
  • 第二个参数是一个logical常量

有关详细信息,请参阅 hybrid vignette

max() 的混合版本在某些方面与 R 实现不同:

  • 没有针对空向量发出警告,静默 returning -Inf
  • NA 向量将 return NA 即使 na.rm = TRUE

在您的示例中,c(NA, NA)logical 的向量,因此 dplyr 回退到 "regular" 评估,每个组都有一个 R 回调。如果您需要原始行为,只需使用包装器或别名即可;混合评估器将回退到常规评估:

max_ <- max
data_frame(a = NA_real_) %>% summarise(a = max_(a, na.rm = TRUE))
## # A tibble: 1 × 1
##       a
##   <dbl>
## 1  -Inf
## Warning message:
## In max_(a, na.rm = TRUE) : no non-missing arguments to max; returning -Inf