文章中的交叉引用

Question

本书提供了很好的方程式、图形、表格和章节的交叉引用选项： https://bookdown.org/yihui/bookdown/cross-references.html

但是，当我设置为输出时它们似乎不起作用 'rticles::elsevier_article'。

文章中交叉引用的可用选项有哪些？

Answer 1

我没试过，但这里有一个可能的解决方案：https://bookdown.org/yihui/bookdown/a-single-document.html

特别是，在您的 YAML 元数据中指定：

output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article

Answer 2

因为我是 R Markdown 的新手，所以我决定 post 这个答案，因为有些人可能会犯同样的错误。我自己尝试了 F Rodriguez-Sanchez 答案，但没有用。我收到以下消息：

! LaTeX Error: File `elsarticle.cls' not found.

! Emergency stop.
<read *> 

Erro: Failed to compile report.tex. See report.log for more info.

它没有用，因为我犯了一个新手错误，因为我试图添加建议的答案选择 New Markdown 然后选择 Document。

然后我尝试打开 New R Markdown 从 rticles 包中选择 From Template 和 Elsevier Journal Article。之后，我使用了 F Rodriguez-Sanchez 建议的答案并且有效！

最终的 yaml header 是：

---
title: Short Paper
author:
  - name: Alice Anonymous
    email: alice@example.com
    affiliation: Some Institute of Technology
    footnote: Corresponding Author
  - name: Bob Security
    email: bob@example.com
    affiliation: Another University
address:
  - code: Some Institute of Technology
    address: Department, Street, City, State, Zip
  - code: Another University
    address: Department, Street, City, State, Zip
abstract: |
  This is the abstract.

  It consists of two paragraphs.

journal: "An awesome journal"
date: "`r Sys.Date()`"
bibliography: mybibfile.bib
output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article
---

Answer 3

@maycca 请确保通过从模板中选择新文件和select Elsevier Journal version/template 打开 RMarkdown。模板将在文章安装后可用。

这将设置文章“基础结构”（特别是相应的 cls 和其他文件）。这还包括一个 mybibfile.bib 示例（因此，我不需要将参考书目注释掉）。如果您选择将其保存在 sub-folder 中，请确保您的 Rmd 文件保存在 sub-folder.

中

如前所述 above/below 更改 YAML 的 output: 标签以包含 bookdown 和基本格式 rticles::elsevier_article 指针。
仔细检查冒号和制表符的使用。

基于上面的示例，您可以使用如下所示的 bookdown cross-referencing。我用了
(i) 使用 (ref:awesomeplotcaption) 在代码块之前定义的外部（bookdown）图形标题。这对于保持块选项简短（呃）很有用。
(ii) a (bookdown) cross-reference 到图 \@ref(fig:awesomeplot)。请注意 \@ref(fig:...) 使用 chunk-name 使指针工作。因此，请确保您的 chunk-name 带有标准字母、数字和破折号，即没有下划线！

按下针织按钮就会产生奇迹！

---
title: Short Paper
author:
  - name: Alice Anonymous
    email: alice@example.com
    affiliation: Some Institute of Technology
    footnote: Corresponding Author
  - name: Bob Security
    email: bob@example.com
    affiliation: Another University
address:
  - code: Some Institute of Technology
    address: Department, Street, City, State, Zip
  - code: Another University
    address: Department, Street, City, State, Zip
abstract: |
  This is the abstract.

  It consists of two paragraphs.

journal: "An awesome journal"
date: "`r Sys.Date()`"
#bibliography: mybibfile.bib
output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article
---

# First Heading

Some cool introductory text.

And an even more fascinating plot.

(ref:awesomeplotcaption) A simple demo plot

```{r awesomeplot, fig.cap="(ref:awesomeplotcaption)"}
x <- -5:5
y <- x^2

plot(x,y)
```

More explanatory text.

Using bookdown cross-referencing, have again a closer look at Fig. \@ref(fig:awesomeplot).

结果如下：

P.S。关注 cross-reference 而忽略 code-chunk，这可以用 echo = FALSE 隐藏。下图如下（在本例中，通过 LATEX 放置）。我截断了它以使数字易于管理:)

文章中的交叉引用

Cross-referencing in rticles

r

knitr

r-markdown

bookdown