使 R shiny renderPlot 对文本输入有反应

make R shiny renderPlot reactive to text input

我正在开发我的第一个 Shiny 应用程序,但我无法使我的情节的输入参数对用户在 textInput 框中的输入做出反应。

这是一个简化的代码示例,对于之前使用过 shiny 的人来说应该很熟悉。

#ui.R
library(shiny)
shinyUI(fluidPage(
  titlePanel("Shiny App"),

  sidebarLayout(
    sidebarPanel(h2("Menu"),

mainPanel(h1("Main"),
tabPanel("Differential Expression",
         column(6,
               p("Input your gene of interest below"),
               textInput(uiOutput("GeneVariable"), label = h4("Gene of interest"),
               value = "Gjb2"),
               submitButton("Submit")),
         plotOutput("plot2"),

    )
  )
))

#server.R
shinyServer(function(input, output) {

 output$plot2 <- renderPlot({
    scde.test.gene.expression.difference("GeneVariable", 
                                         models=o.ifm, counts=cd, prior=o.prior)
  })

GeneVariable <- reactive({ ###I don't know what to put here#####
  })
})

我需要用户能够在 "GeneVariable" 位置的文本输入框中输入基因名称,并让 scde.test.gene.expression.difference 函数处理名称。

感谢您的帮助和耐心,我是新手。

以下解决了这个问题

#ui.R
library(shiny)
shinyUI(fluidPage(
  titlePanel("Shiny App"),

  sidebarLayout(
    sidebarPanel(h2("Menu"),

mainPanel(h1("Main"),
tabPanel("Differential Expression",
         column(6,
               p("Input your gene of interest below"),
               textInput("input$GeneVariable"), label = h4("Gene of interest"),
               value = "Gjb2"),
               submitButton("Submit")),
         plotOutput("plot2"),

    )
  )
))

.

#server.R
shinyServer(function(input, output) {

 output$plot2 <- renderPlot({
    scde.test.gene.expression.difference(input$`input$GeneVariable`, 
                                         models=o.ifm, counts=cd, prior=o.prior)
  })

GeneVariable <- reactive({input$GeneVariable})
  })
})

关键是使用 input$'input$GeneVariable' 将用户的反应输入打印到绘图函数中。