汇总分组 pandas 数据帧和 return NaN 中的行

Question

例子

import pandas as pd
import numpy as np
d = {'l':  ['left', 'right', 'left', 'right', 'left', 'right'],
     'r': ['right', 'left', 'right', 'left', 'right', 'left'],
     'v': [-1, 1, -1, 1, -1, np.nan]}
df = pd.DataFrame(d)

问题

当分组数据帧包含 np.NaN 的值时，我希望分组总和为 NaN，正如 pd.Series.sum and also pd.DataFrame.sum 的 skipna=False 标志所给出的那样，但是，这

In [235]: df.v.sum(skipna=False)
Out[235]: nan

但是，此行为并未反映在 pandas.DataFrame.groupby 对象中

In [237]: df.groupby('l')['v'].sum()['right']
Out[237]: 2.0

并且不能通过直接应用np.sum方法来强制

In [238]: df.groupby('l')['v'].apply(np.sum)['right']
Out[238]: 2.0

解决方法

我可以通过

解决这个问题

check_cols = ['v']
df['flag'] = df[check_cols].isnull().any(axis=1)
df.groupby('l')['v', 'flag'].apply(np.sum).apply(
    lambda x: x if not x.flag else np.nan,
    axis=1
)

但这很难看。有没有更好的方法？

Answer 1

这是你想要的吗？

In [24]: df.groupby('l')['v'].agg(lambda x: np.nan if x.isnull().any() else x.sum())
Out[24]:
l
left    -3.0
right    NaN
Name: v, dtype: float64

或

In [22]: df.groupby('l')['v'].agg(lambda x: x.sum() if x.notnull().all() else np.nan)
Out[22]:
l
left    -3.0
right    NaN
Name: v, dtype: float64

Answer 2

我认为这是 pandas 所固有的。解决方法可以是：

df.groupby('l')['v'].apply(array).apply(sum)

模仿 numpy 的方式，

或

df.groupby('l')['v'].apply(pd.Series.sum,skipna=False) # for series, or
df.groupby('l')['v'].apply(pd.DataFrame.sum,skipna=False) # for dataframes.

调用好的函数。

Answer 3

我不确定这属于丑陋程度的哪个范围，但它有效：

>>> series_sum = pd.core.series.Series.sum
>>> df.groupby('l')['v'].agg(series_sum, skipna=False)
l
left     -3
right   NaN
Name: v, dtype: float64

刚挖出你取df.v.sum时用的sum方法，支持skipna选项：

>>> help(df.v.sum)
Help on method sum in module pandas.core.generic:

sum(axis=None, skipna=None, level=None, numeric_only=None, **kwargs) method 
of pandas.core.series.Series instance

Answer 4

df.groupby(xxx).yyy.apply(lambda x: x.sum(skipna=False))

汇总分组 pandas 数据帧和 return NaN 中的行

Summing rows in grouped pandas dataframe and return NaN

python

numpy

nan

dataframe

pandas

例子

问题

解决方法