Biopython 可以解析 Derwent GENESEQ 格式吗?
Can Biopython parse Derwent GENESEQ format?
我正在尝试解析 Derwent GENESEQ 数据库中的文件。
这些文件应该是 EMBL 格式的,但是有一些小的差异会破坏 SeqIO.parse('foo.dat', 'embl')
。有没有人用 Biopython 或其他 Python 库成功解析了这些文件?
我最终继承了 Biopython EMBL 解析器并破解了我自己的 GENESEQ 解析器。
我正在尝试解析 Derwent GENESEQ 数据库中的文件。
这些文件应该是 EMBL 格式的,但是有一些小的差异会破坏 SeqIO.parse('foo.dat', 'embl')
。有没有人用 Biopython 或其他 Python 库成功解析了这些文件?
我最终继承了 Biopython EMBL 解析器并破解了我自己的 GENESEQ 解析器。