我如何 return 从 Rcpp 到 R 的矩阵列表?
How can I return a list of matrices from Rcpp to R?
我在 Rcpp 中有一个函数做这样的事情:它创建一个 std::list 类型的矩阵列表,并打算 return 将该矩阵列表返回给 R。
我在这里附上一个简化的例子:
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::export]]
Rcpp::List splitImagesRcpp(arma::mat x)
{
std::list<arma::mat> listOfRelevantImages;
int relevantSampleSize = x.n_rows;
for(int k = 0; k < relevantSampleSize; ++k)
{
listOfRelevantImages.push_back(x.row(k));
}
return wrap(listOfRelevantImages);
}
这里的问题是,我想return R 一个矩阵列表,但我得到一个向量列表。我一直在尝试很多并查看文档,但我似乎无法找到解决方案。看起来 wrap 正在完成它的工作,但它也在列表中递归地包装我的矩阵。
我得到这样的结果:
> str(testingMatrix)
List of 200
$ : num [1:400] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ : num [1:400] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
但我想得到这样的东西:
> str(testingMatrix)
List of 200
$ : num [1:40, 1:10] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ : num [1:40, 1:10] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
我想在 Rcpp 中而不是在 R 中执行此操作。那是因为我希望能够将函数与纯 R 编程的函数互换,以便测量加速比。[=14=]
非常感谢任何帮助!
使用 arma::field
class that has the necessary plumbing to convert to and fro R 和 C++.
这里有一些示例代码,说明如何使用字段 class,因为上面的示例不可重现...
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::export]]
arma::field<arma::mat> splitImagesRcpp(arma::mat x) {
// Sample size
int relevantSampleSize = x.n_rows;
// Create a field class with a pre-set amount of elements
arma::field<arma::mat> listOfRelevantImages(relevantSampleSize);
for(int k = 0; k < relevantSampleSize; ++k)
{
listOfRelevantImages(k) = x.row(k);
}
return listOfRelevantImages;
}
示例:
set.seed(1572)
(x = matrix(runif(25), 5, 5))
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# [1,] 0.2984725 0.679958392 0.5636401 0.9681282 0.25082559
# [2,] 0.3657812 0.157172256 0.6101798 0.5743112 0.62983179
# [3,] 0.6079879 0.419813382 0.5165553 0.3922179 0.64542093
# [4,] 0.4080833 0.888144280 0.5891880 0.6170115 0.13076836
# [5,] 0.8992992 0.002045309 0.3876262 0.9850514 0.03276458
(y = splitImagesRcpp(x))
# [,1]
# [1,] Numeric,5
# [2,] Numeric,5
# [3,] Numeric,5
# [4,] Numeric,5
# [5,] Numeric,5
y[[1]]
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# [1,] 0.2984725 0.6799584 0.5636401 0.9681282 0.2508256
我在 Rcpp 中有一个函数做这样的事情:它创建一个 std::list 类型的矩阵列表,并打算 return 将该矩阵列表返回给 R。
我在这里附上一个简化的例子:
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::export]]
Rcpp::List splitImagesRcpp(arma::mat x)
{
std::list<arma::mat> listOfRelevantImages;
int relevantSampleSize = x.n_rows;
for(int k = 0; k < relevantSampleSize; ++k)
{
listOfRelevantImages.push_back(x.row(k));
}
return wrap(listOfRelevantImages);
}
这里的问题是,我想return R 一个矩阵列表,但我得到一个向量列表。我一直在尝试很多并查看文档,但我似乎无法找到解决方案。看起来 wrap 正在完成它的工作,但它也在列表中递归地包装我的矩阵。
我得到这样的结果:
> str(testingMatrix)
List of 200
$ : num [1:400] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ : num [1:400] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
但我想得到这样的东西:
> str(testingMatrix)
List of 200
$ : num [1:40, 1:10] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ : num [1:40, 1:10] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
我想在 Rcpp 中而不是在 R 中执行此操作。那是因为我希望能够将函数与纯 R 编程的函数互换,以便测量加速比。[=14=]
非常感谢任何帮助!
使用 arma::field
class that has the necessary plumbing to convert to and fro R 和 C++.
这里有一些示例代码,说明如何使用字段 class,因为上面的示例不可重现...
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::export]]
arma::field<arma::mat> splitImagesRcpp(arma::mat x) {
// Sample size
int relevantSampleSize = x.n_rows;
// Create a field class with a pre-set amount of elements
arma::field<arma::mat> listOfRelevantImages(relevantSampleSize);
for(int k = 0; k < relevantSampleSize; ++k)
{
listOfRelevantImages(k) = x.row(k);
}
return listOfRelevantImages;
}
示例:
set.seed(1572)
(x = matrix(runif(25), 5, 5))
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# [1,] 0.2984725 0.679958392 0.5636401 0.9681282 0.25082559
# [2,] 0.3657812 0.157172256 0.6101798 0.5743112 0.62983179
# [3,] 0.6079879 0.419813382 0.5165553 0.3922179 0.64542093
# [4,] 0.4080833 0.888144280 0.5891880 0.6170115 0.13076836
# [5,] 0.8992992 0.002045309 0.3876262 0.9850514 0.03276458
(y = splitImagesRcpp(x))
# [,1]
# [1,] Numeric,5
# [2,] Numeric,5
# [3,] Numeric,5
# [4,] Numeric,5
# [5,] Numeric,5
y[[1]]
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
# [1,] 0.2984725 0.6799584 0.5636401 0.9681282 0.2508256