如何增加脚本读取行的计数？

Question

我有这个 table 个值，我想知道如何让程序读取每一行。对于带有 'a'、'g'、'c' 或 'u' 的每一行，我希望它把计数加一。对于这个例子，当我运行它时，它的结果应该是 12。

a  1    0.000 S
g  2    0.260 S
a  3    0.990 S
a  4    0.980 S
c  5    0.000 S
u  6    1.000 S
c  7    0.000 S
a  8    1.000 S
a  9    1.000 T
u 10    0.820 S
a 11    1.000 T
g 12    0.000 S
F 13    1.000 S
S 14    1.000 S
T 15    1.000 S

我试过的代码如下：

rna_residues = ['a','c','g','u']
count_dict = {}
        #Making the starting number 0
        rna_count = 0
        #if any lines of the file starts with one of the rna_residue
        if line.startswith(tuple(rna_residues)):
            for residue in line:
                if residue in rna_residues:
                    rna_count += 1
            count_dict[line] = [rna_count]  
            print count_dict

不知怎么的，当我运行它的时候，没有列表的计数：

{'a  1    0.000 S\n': [1]}
{'g  2    0.260 S\n': [1]}
{'a  3    0.990 S\n': [1]}
{'a  4    0.980 S\n': [1]}
{'c  5    0.000 S\n': [1]}
{'u  6    1.000 S\n': [1]}
{'c  7    0.000 S\n': [1]}
{'a  8    1.000 S\n': [1]}
{'a  9    1.000 T\n': [1]}
{'u 10    0.820 S\n': [1]}
{'a 11    1.000 T\n': [1]}
{'g 12    0.000 S\n': [1]}

我知道这是很多信息，但是有什么提示可以帮助我吗？非常感谢！！

Answer 1

您正在使用整行作为字典中的关键字，因此除非您有相同的行，否则所有值都将为 1。您为什么需要字典？我的印象是您想计算以任何字符 'a','c','g','u'.

开头的行数

为此，以下代码就足够了：

rna_residues = ['a','c','g','u']
rna_count = 0
with open('/path/to/file') as opened_file:    
    for line in opened_file:
        # or if line[0] in rna_residues
        if any(line.startswith(residue) for residue in rna_residues):
            rna_count += 1
print rna_count
# 12

如何增加脚本读取行的计数？

How to increase count as script reads lines?

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