如果所有分支都具有相同的值，则从 phytree 中删除叶子
Remove leafs from phytree if all the branches have same value
我正在使用 MATLAB 生成 'phytrees'，我需要对其进行简化。
我的想法是删除所有节点都具有相同值的子树，只保留这个值+一个代表删除了多少节点的数字。
例如，这是其中一棵树：
我想替换具有相同值的子树，如下所示：
有办法吗？
我没有找到程序化的方法，但从你附上的图片我看到你使用 plot 查看你的身材。如果相反，您将使用 phytreeviewer（只需键入 view(your_phylotree)），您将得到一个不同的数字 window，以及其他相关工具。
具体来说，您会看到折叠分支 按钮, and the Rename branch button ，它们将共同为您提供您想要的内容。第一个“删除子树”（实际上是隐藏它们），第二个让您将分支名称更改为“value + 数字”。
您也可以通过简单地右键单击相关早午餐来完成所有这些操作：
这是一个示例，数据来自 docs:
% bulding some tree:
seqs = fastaread('pf00002.fa');
distances = seqpdist(seqs,'method','jukes-cantor','indels','pair');
phylotree = seqneighjoin(distances,'equivar',seqs);
view(phylotree)
在这棵树上进行一些折叠和重命名，并将其打印成图形（右键单击要包含在图形中的最上面的分支或根）之后，我得到：
此外，请注意，每次将鼠标悬停在一个分支上（即使已折叠），您都会获得该分支中的叶子列表及其数量：
我正在使用 MATLAB 生成 'phytrees'，我需要对其进行简化。
我的想法是删除所有节点都具有相同值的子树，只保留这个值+一个代表删除了多少节点的数字。
例如，这是其中一棵树：
我想替换具有相同值的子树，如下所示：
有办法吗？
我没有找到程序化的方法，但从你附上的图片我看到你使用 plot 查看你的身材。如果相反，您将使用 phytreeviewer（只需键入 view(your_phylotree)），您将得到一个不同的数字 window，以及其他相关工具。
具体来说，您会看到折叠分支 按钮
您也可以通过简单地右键单击相关早午餐来完成所有这些操作：
这是一个示例，数据来自 docs:
% bulding some tree:
seqs = fastaread('pf00002.fa');
distances = seqpdist(seqs,'method','jukes-cantor','indels','pair');
phylotree = seqneighjoin(distances,'equivar',seqs);
view(phylotree)
在这棵树上进行一些折叠和重命名，并将其打印成图形（右键单击要包含在图形中的最上面的分支或根）之后，我得到：
此外，请注意，每次将鼠标悬停在一个分支上（即使已折叠），您都会获得该分支中的叶子列表及其数量：