R中的时间序列层次聚类按列

Question

我正在尝试使用 tsclust 进行时间序列聚类，我的数据集如下所示：

我有超过 500 个时间序列，每个时间序列有八个观测值，每个观测值都在同一时间线上。我对它应用了 tsclust 但按时间而不是按系列获得了集群（如下所示）：

后来我发现tsclust只能按行工作。（来自www.rdocumentation.org/packages/dtwclust/versions/3.1.1/topics/tsclust）

是否还有其他类似的函数可以用来完成聚类分析？或者我怎样才能改变我的数据格式来做到这一点？

我的原始代码如下所示：

tst<-read.csv("data.csv", stringsAsFactors = TRUE)
tst<-xts(tst[,-1], order.by = as.Date(paste0(tst[,1])))

par(mar=c(1,1,1,1))
plot.xts(tst)

series <- zscore(tst)

hc.sbd <- tsclust(series, type = "h", k = 6L,
              preproc = zscore, seed = 233,
              distance = "sbd", centroid = shape_extraction,
              control = hierarchical_control(method = "average"))
plot(hc.sbd)
plot(hc.sbd, type = "sc")

感谢任何帮助。提前谢谢你。

Answer 1

使用 t 转置您的数据。

将列转换为行。

R中的时间序列层次聚类按列

Time Series Hierarchical Clustering in R column-wise

r

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tsclust