从邻接矩阵开始时如何添加顶点/节点信息？

Question

这似乎是一件很简单的事情，但我想不通。我创建了一个邻接矩阵，指定了哪些节点连接到哪个节点，这是一个有向图。

我可以用 graph_from_adjacency_matrix(matrix)

我还有一个数据框，其中包含每个节点的规格 f.i.

data.frame(id = c("A", "B","C","D"), 
           color = c("red","red", "green","deathmetal black"), 
           shoesize = c(31,32,33,50))

如何将这些信息合并到 1 个图表中以进行绘图？

Answer 1

您可以合并节点属性值 set_vertex_attr

如果你有

matrix <- structure(c(0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 
0L, 0L, 0L), .Dim = c(4L, 4L), .Dimnames = list(c("A", "B", "C", 
"D"), c("A", "B", "C", "D")))
gg <- graph_from_adjacency_matrix(matrix)

那你可以

data.frame(id = c("A", "B","C","D"), 
           color = c("red", "red", "green", "deathmetal black"), 
           shoesize = c(31,32,33,50), stringsAsFactors=FALSE)
gg <- set_vertex_attr(gg, "color", dd$id, dd$color)
gg <- set_vertex_attr(gg, "shoesize", dd$id, dd$shoesize)

Answer 2

使用 tidygraph 包的方法略有不同：

as_tbl_graph(matrix) %>% left_join(data, by=c('name'='id'))

根据 Thomas Lin Pederson（tidygraph 的创建者）的说法。

从邻接矩阵开始时如何添加顶点/节点信息？

How do you add vertice / node information when starting from adjacency matrix?

r

igraph