GNU Parallel 中的基本名称

Question

我有几百个文件，命名如下：

RG1-t.txt

RG1-n.txt

RG2-t.txt

RG2-n.txt

等...

我想使用与运行脚本并行的 GNU，但我很难获得文件的基本名称，所以 RG1、RG2 等...这样我就可以运行 :

ls RG*.txt | parallel "command.sh {basename}-t.txt {basename}-n.txt > {basename}.out"

生成文件 RG1.out、RG2.out 等。有什么想法吗？

Answer 1

尝试像这样喂 parallel：

ls RG*t.txt | cut -d'-' -f1 | parallel 'command.sh {}-t.txt {}-n.txt > {}.out'

或者，如果您喜欢 awk：

ls RG*t.txt | awk -F'-' '{print }' | parallel ...

或者，如果您更喜欢 sed：

ls RG*t.txt | sed 's/-.*//' | parallel ...

或者，如果您更喜欢 GNU grep:

ls RG* | grep -Po '.*(?=-t.txt)' | parallel ...

Answer 2

使用--rpl:

printf '%s[=10=]' RG*-n.txt |
  parallel -0 --rpl '{basename} s/-..txt$//' "command.sh {basename}-t.txt {basename}-n.txt > {basename}.out"

或动态替换字符串 --plus:

printf '%s[=11=]' RG*-n.txt |
  parallel -0 --plus "command.sh {%-n.txt}-t.txt {} > {%-n.txt}.out"

printf避免：

bash: /bin/ls: Argument list too long

Answer 3

使用built-in stripping options:

Dirname ({/}) and basename ({%}) and remove custom suffix ({^suffix})

$ echo dir/file_1.txt.gz | parallel --plus echo {//} {/} {%_1.txt.gz}

Get basename, and remove last ({.}) or any ({:}) extension

$ echo dir.d/file.txt.gz | parallel 'echo {.} {:} {/.} {/:}'

这应该可以满足您的需要：

ls RG*.txt | parallel "command.sh {.}-t.txt {.}-n.txt > {.}.out"

GNU Parallel 中的基本名称

Basename in GNU Parallel

gnu

gnu-parallel