如何在 Python 中捕获 rpy2.rinterface.RRuntimeError？

Question

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Python 3.5.3 |Continuum Analytics, Inc.| （默认，2017 年 3 月 6 日，12:15:08）
Mac OSX 10.13.1

问题：

我已经下载了以下 R 脚本 https://github.com/daleroberts/heston/blob/master/heston.r 我使用包 RPy2 通过 Python 反复调用其中的一个函数。现在，对于我输入 R 函数的一些输入，R returns 出现以下错误：

rpy2.rinterface.RRuntimeError: Error in integrate(PIntegrand, lower = 0, upper = Inf, lambda, vbar, eta, : roundoff error was detected

如何在 Python 中捕获此 RuntimeError？

Answer 1

Python 使捕捉异常变得相对容易。

try:
    # some code
except Exception, e:
    # Log the exception.

Answer 2

RRuntimeError 派生自 Exception，因此您应该能够像处理任何其他异常一样捕获它。

try:
    # your code
except rpy2.rinterface.RRuntimeError:
    # handle exception

在 rpy2 v3.0 及更高版本中，RRuntimeError 似乎已被移动到其他地方（参见示例代码 from documentation）因此您可能需要使用改为：

try:
    # your code
except rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError:
    # handle exception

更多相关信息：https://docs.python.org/3/tutorial/errors.html#handling-exceptions

Answer 3

我无法让 rpy2.rinterface.RRuntimeError 工作，但下面的解决方法对我有用。

正在安装 tryCatchLog：

%%R
install.packages('tryCatchLog')
library('tryCatchLog')

如果在函数中使用它：

def test_R_error_handling():
  %R tryCatchLog( expr = result <- 'a'+2, finally = result <- -1 )
  result = ro.globalenv['result'][0]
  if result == -1:
    print(result)
    return
  else:
    print('\nFunction continued')
    return True

这是关于 my post rpy2 错误处理。我希望这可以帮助遇到同样问题的任何人。

如何在 Python 中捕获 rpy2.rinterface.RRuntimeError？

How do I catch an rpy2.rinterface.RRuntimeError in Python?

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