从 igraph-python 获取二维坐标

Question

我有一个带有 igraph 的代码生成网络，我想检索节点的二维坐标（Xs 和 Ys）（我不需要边）以便能够在其他 space 中绘制结果，让我们说 JavaScript。这是从 numpy 矩阵可视化网络的代码示例：

import igraph
import numpy
A = numpy.zeros(shape=(5,5))
A[0] = [0,1,1,1,1]
A[1] = [1,0,1,0,1]
A[2] = [1,1,0,1,0]
A[3] = [1,0,1,0,1]
A[4] = [1,1,0,1,0]
g = igraph.Graph.Adjacency((A > 0).tolist())
g.es['weight'] = A[A.nonzero()]
igraph.plot(g)

是否可以检索坐标，最好不要在 python 中可视化网络，比方说在字典中？可以用其他包来完成吗，比如 pygraphviz ？

Answer 1

由于您对情节本身不感兴趣，只需调用任何布局函数（有几个，简单地调用 layout 指向默认值，IIRC），所有这些 return 一个 layout 对象，具有包含 x 和 y 位置的 coords 属性。

layout_obj = g.layout()
x, y = np.array(layout_obj.coords).T

从 igraph-python 获取二维坐标

Getting 2d coordinates from igraph-python

python

coordinates

igraph