AWS CannotPullContainerError 没有 space 留在设备 Docker 上
AWS CannotPullContainerError no space left on device Docker
我正在尝试使用大型 docker 图像(图像位于 dockerhub here 上,大约 18GB)作为 AWS 批处理的作业定义。我从 space 中收到关于 运行ning 的以下错误:
CannotPullContainerError: write /var/lib/docker/tmp/GetImageBlob#######: no space left on device
定义作业的 Cloudformation JSON 部分在此处
"JobDef3": {
"Type": "AWS::Batch::JobDefinition",
"Properties": {
"Type": "container",
"ContainerProperties": {
"Image": {
"Fn::Join": [
"",
[
"cornhundred/",
"dockerized-cellranger-nick:latest"
]
]
},
"Vcpus": 1,
"Command": ["some command"],
"Memory": 3000,
},
"RetryStrategy": {
"Attempts": 1
}
}
},
如何让 AWS 增加 space 可用的数量,以便我可以 运行 此图像?
通过将大文件(~15GB 参考基因组文件)移出 docker 图像并在 [=15= 之后下载它们,我能够 运行 docker 容器] 装容器。我还需要制作自定义 Amazon 机器映像(AMI,请参阅 AWS Batch Genomics 示例)并附加一个卷来处理大型参考基因组文件,因为默认容器不够大。
我遇到了类似的问题。清除未使用的 docker 图像和卷对我不起作用(即 docker container prune
或 docker system prune
我看到另一个页面说重新启动 docker 为该用户修复了它,但是执行 service docker restart
我得到了这个错误:/etc/init.docker:第 35 行:ulimit:打开文件:无法修改限制:不允许操作
为了尝试解决这个问题,我看到网站提到要更新某些配置文件中的 ulimit 值,但是当我尝试使用更新后的参数保存文件时,我遇到了 写入错误(文件系统已满?)
此时,我意识到(正如您最初显示的错误)我需要清理并删除文件。
我从根文件夹中执行了 du -h
并看到 /var/lib/docker/tmp/
文件夹(这是我遇到的错误消息的一部分,你在上面发布)用掉了更多磁盘 space 比其他文件夹。
所以我删除了那里的旧文件,我不再收到该错误消息。
我正在尝试使用大型 docker 图像(图像位于 dockerhub here 上,大约 18GB)作为 AWS 批处理的作业定义。我从 space 中收到关于 运行ning 的以下错误:
CannotPullContainerError: write /var/lib/docker/tmp/GetImageBlob#######: no space left on device
定义作业的 Cloudformation JSON 部分在此处
"JobDef3": {
"Type": "AWS::Batch::JobDefinition",
"Properties": {
"Type": "container",
"ContainerProperties": {
"Image": {
"Fn::Join": [
"",
[
"cornhundred/",
"dockerized-cellranger-nick:latest"
]
]
},
"Vcpus": 1,
"Command": ["some command"],
"Memory": 3000,
},
"RetryStrategy": {
"Attempts": 1
}
}
},
如何让 AWS 增加 space 可用的数量,以便我可以 运行 此图像?
通过将大文件(~15GB 参考基因组文件)移出 docker 图像并在 [=15= 之后下载它们,我能够 运行 docker 容器] 装容器。我还需要制作自定义 Amazon 机器映像(AMI,请参阅 AWS Batch Genomics 示例)并附加一个卷来处理大型参考基因组文件,因为默认容器不够大。
我遇到了类似的问题。清除未使用的 docker 图像和卷对我不起作用(即 docker container prune
或 docker system prune
我看到另一个页面说重新启动 docker 为该用户修复了它,但是执行 service docker restart
我得到了这个错误:/etc/init.docker:第 35 行:ulimit:打开文件:无法修改限制:不允许操作
为了尝试解决这个问题,我看到网站提到要更新某些配置文件中的 ulimit 值,但是当我尝试使用更新后的参数保存文件时,我遇到了 写入错误(文件系统已满?)
此时,我意识到(正如您最初显示的错误)我需要清理并删除文件。
我从根文件夹中执行了 du -h
并看到 /var/lib/docker/tmp/
文件夹(这是我遇到的错误消息的一部分,你在上面发布)用掉了更多磁盘 space 比其他文件夹。
所以我删除了那里的旧文件,我不再收到该错误消息。