尝试运行 BioPython 测试时出现解析 sys.version 错误

Question

在装有 python 2.7.14 的机器上安装了 BioPython 1.70。想要通过运行ning 测试来验证设置。

$ python run_tests.py
Traceback (most recent call last):
  File "run_tests.py", line 148, in <module>
    if is_numpy():
  File "run_tests.py", line 63, in is_numpy
    if is_pypy():
  File "run_tests.py", line 54, in is_pypy
    if platform.python_implementation() == 'PyPy':
  File "/home/foo/python/lib/python2.7/platform.py", line 1460, in python_implementation
    return _sys_version()[0]
  File "/home/foo/python/lib/python2.7/platform.py", line 1422, in _sys_version
    repr(sys_version))
ValueError: failed to parse CPython sys.version: '2.7.14 |Anaconda, Inc.| (default, Dec  7 2017, 17:05:42) \n[GCC 7.2.0]'

如果我想要运行任何测试，是否必须编辑 /home/foo/python/lib/python2.7/platform.py？

Answer 1

原来是我的 PYTHONPATH 问题。

~/anaconda2/lib/python2.7 需要放在第一位。我之前有 ~/lib/python，所以它使用了错误的 platform.py 文件。

尝试运行 BioPython 测试时出现解析 sys.version 错误

Getting error parsing sys.version when try to run BioPython tests

python

biopython

anaconda

尝试 运行 BioPython 测试时出现解析 sys.version 错误

Getting error parsing sys.version when try to run BioPython tests

python

biopython

anaconda

尝试运行 BioPython 测试时出现解析 sys.version 错误