试图将特定文件复制到特定文件夹，但有一个问题

Question

我正在尝试将特定文件复制到特定文件夹，但文件名类似于 Long_John_Silver、Miss_Havisham 和 Master_Pip，文件夹名称类似于 Long、Miss 和 Master。所以基本上我试图将文件复制到它们各自的文件夹中，例如Master_Pip.txt 到名为 Master 的文件夹中。因此，我试图做的是捕获文件名的第一个单词，并以某种方式将其用作参考，但是，正是在这一点上，我犹豫不决。

for fldr in /home/playground/genomes* ; do

find . -name *fna.gz | while read f ; do

    f_name=$( echo $fldr | cut -d '/' -f 7 | cut -d '_' -f 1) ;

    #echo $f_name ;

    if [ "$f_name" == /home/playground/port/"$f_name" ]; then

        cp -r "$f" /home/playground/port/"$f_name"/ ;

    else

        continue    

    fi

done

done

编辑---------------------------------------- ---

for fldr in /home/p995824/scripts/playground/genomes_2/* ; do

find . -name *fna.gz | while read f ; do

    basenm=${fldr##*/} ; f_name=${basenm%%_*} ; 


    cp -r $f /home/p995824/scripts/playground/port/$f_name/ ;

done

done

此脚本将所有文件复制到所有文件夹。但是我正在努力构建一个条件语句，该语句将特定于将每个文件复制到哪个文件夹。如您所见，我已经尝试了 if 语句，但我一定是错误地构建了它。非常感谢任何帮助。

Answer 1

我认为您的比较 if [ "$f_name" == /home/playground/port/"$f_name" ] 不正确。 $f_name 是文件名的前缀，您将其与完整路径进行比较。

试试这个：

for fldr in /home/playground/genomes* ; do

find . -name *fna.gz | while read f ; do

    # basename will truncate the path leaving only the filename
    f_name=$( basename ${fldr} | cut -d'_' -f1) ;

    # $f_name is the filename prefix "Long", "Master", etc

    # if the directory exists (-d)
    if [ -d "/home/playground/port/$f_name" ]; then

        # I don't think you need (-r) here if you're just copying a single file
        cp "$f" "/home/playground/port/$f_name/" ;

    else

        continue    

    fi

done

done

Answer 2

这是一个可能的解决方案：

for fldr in  `find /tmp/playground/  -type f` 
do 
    NAME=`basename $fldr | cut -d_ -f1`
    DEST=/tmp/playground/$NAME
    if [ -d "$DEST" ]  
    then
        cp $fldr $DEST
    fi 
done

Answer 3

也许你可以反过来做？搜索与文件夹名称匹配的文件并复制它们，而不是从文件名的第一个单词搜索文件夹。不过我可能错了.. :)

for folder_name in /home/playground/port/*
do
    cp /home/playground/folder_name* $folder_name
done

Answer 4

我意识到我正在根据文件类型将所有文件复制到所有文件夹中，即 .fna.gz，所以我指定了我想要读取的 fna.gz 文件类型，并且然后复制。不需要 if 语句，因为通过参数扩展隐含了特异性。它现在完美运行。

for fldr in /home/scripts/playground/genomes_2/* ; do

basenm=${fldr##*/} ; f_name=${basenm%%_*} ; 

find . -name $f_name*fna.gz | while read f ; do

    cp -r $f /home/scripts/playground/port/$f_name/ ;



done

done

试图将特定文件复制到特定文件夹，但有一个问题

Trying to copy specific files to specific folders, but there's a catch

unix

linux

bash

if-statement

nested-loops