如何修改CMakeList.txt：找到库，但存在链接错误

Question

我正在创建一个用 cmake 构建的 C 库，使用 Mac OS 进行开发。在CMakeList.txt中，我有以下

#htslib
find_package(htslib REQUIRED)
include_directories(${HTSLIB_INCLUDE_DIR})


target_link_libraries(projectname ${HTSlib_LIBRARIES})

在 cmake ..

上输出

Found hstlib

但是，在 make 之后，我遇到了链接器错误：

clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

所以...它可以找到库，并且库肯定是用sudo make install安装的，但是只有这个库有链接错误。

(1) 我猜 find_package(htslib REQUIRED) 正在寻找其他东西。我如何找出什么？

(2) 如何在 CMakeList.txt 中明确写入以找到我知道已正确安装的库？

Answer 1

使用VERBOSE=1 make查看链接器输出。搜索 -lhtslib
阅读特定 Find<LIB>.cmake 的文档。

您的具体问题：

"How do I find what CMake found"：使用cmake-gui或ccmake。它们都显示相同的信息，但一个是 GUI，另一个是 Curses 界面。在高级模式中（"t" on ccmake），您将找到搜索包的所有变量。此外，您可以使用 MESSAGE(STATUS "Found htslib at: ${htslib_LIBRARIES}").
"How to explicitly write in CMakeLists.txt where the library is?"请不要那样做！ CMake 旨在准确地抽象出这种信息。您有两个选择，第一个是好的：在命令行（或在上述 GUI 中）配置 cmake 以获得 CMAKE_MODULES_PATH 或更具体的库提示 -D htslib_PATH=/usr/local/.../（指向目录libhts.dylib 所在的位置）。更糟糕的解决方案是向 find_package 提供提示。 find_package(htslib REQUIRED PATH /usr/local/lib) 或 find_package(htslib REQUIRED HINT /usr/local/lib /some/second/path/where/it/may/be).

解决方案

您的链接项目有自定义 FindHTSlib.cmake link。这个使用 pkg_config 配置库。为了重现您的问题，我使用了 brew 来安装 htslib。 pkg-config 文件可以在 /usr/local/Cellar/htslib/1.8/lib/htslib.pc 下找到（对我来说，但 brew info htslib 告诉你）。所以，让我们给 CMake 所需的提示。

我无法测试这个，因为对我来说它直接找到了 htslib 包，没有进一步的提示。

git clone https://github.com/D-Lo/bamdb # I am using version f5f03d0
mkdir -p bamdb/build; cd bamdb/build
brew install ck htslib lmdb
cmake ..  # -G Ninja recommended, but needs brew install ninja
make # lot's of missing symbols

我建议将 CMakeLists.txt CMake 的最低要求版本从 2.8 更改为 3.10（或至少 3.6）。

这是我得到的错误：

[ 62%] Linking C shared library libbamdb.dylib
/usr/local/Cellar/cmake/3.11.1/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/libbamdb.dir/link.txt --verbose=1
/Library/Developer/CommandLineTools/usr/bin/cc -Wall -g -std=gnu99 -fPIC -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names  -o libbamdb.dylib -install_name @rpath/libbamdb.dylib CMakeFiles/libbamdb.dir/src/bam_api.c.o CMakeFiles/libbamdb.dir/src/bam_lmdb.c.o CMakeFiles/libbamdb.dir/src/bamdb.c.o
Undefined symbols for architecture x86_64:
  "_bam_destroy1", referenced from:
      _get_bam_row in bam_api.c.o
      _deserialize_func in bam_lmdb.c.o

这可以通过在 CMakeLists.txt 行 add_library(libbamdb ${SOURCES}):

之后添加以下行来解决

target_link_libraries(libbamdb ${LIBS})

一些进一步的注意事项：您现在有一个带有 main 函数的库。这是因为 ${SOURCES} 用于构建可执行文件和库。这可能会产生意想不到的副作用。除非需要，否则不要这样做。

如何修改CMakeList.txt：找到库，但存在链接错误

How to modify CMakeList.txt: library found, but there are linking errors

c

cmake

clang

linker-errors

解决方案