Python - 3D 切片器和从图像中检索灰度和白色数据
Python - 3D slicer & grey and white data retrieval from a image
我必须做一个项目,我必须在其中分析图像并从该图像中获取数据(白质和灰质),然后必须绘制该大脑图像的 3 个切片器。
现在我已经在pycharm中安装了OpenCV和numpy和matplotlib。我正在使用windows平台,请大家帮我完成这个项目。
要深入了解您的数据,您可以下载程序 3D Slicer (https://download.slicer.org),然后您应该能够加载图像。由于它支持多种格式(DICOM、nrrd、nifti 等等),您应该可以加载它。
然后 "analyze" 你自己,你可以利用嵌入式 python 解释器并访问与卷对应的 numpy 数组。
它还包括一组广泛的模块来处理、转换、分割、配准您的图像。此处提供的教程应该会有所帮助:https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Training
在相关论坛上作为您的问题也可能是明智的:http://discourse.slicer.org/
我使用切片器进行组织class化。这不是很准确。我建议您开始使用期望最大化 (EM) 并为您的高斯定义一个 3 class 的组织。
如果您可以访问 PMOD 软件,它有一个非常好的工具,可以在大脑数据中 class 化。
我必须做一个项目,我必须在其中分析图像并从该图像中获取数据(白质和灰质),然后必须绘制该大脑图像的 3 个切片器。
现在我已经在pycharm中安装了OpenCV和numpy和matplotlib。我正在使用windows平台,请大家帮我完成这个项目。
要深入了解您的数据,您可以下载程序 3D Slicer (https://download.slicer.org),然后您应该能够加载图像。由于它支持多种格式(DICOM、nrrd、nifti 等等),您应该可以加载它。
然后 "analyze" 你自己,你可以利用嵌入式 python 解释器并访问与卷对应的 numpy 数组。
它还包括一组广泛的模块来处理、转换、分割、配准您的图像。此处提供的教程应该会有所帮助:https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Training
在相关论坛上作为您的问题也可能是明智的:http://discourse.slicer.org/
我使用切片器进行组织class化。这不是很准确。我建议您开始使用期望最大化 (EM) 并为您的高斯定义一个 3 class 的组织。
如果您可以访问 PMOD 软件,它有一个非常好的工具,可以在大脑数据中 class 化。