rcorr 在 cor 完美工作的地方给出错误（需要相关矩阵的 p 值）

Question

我需要为使用 cor 创建的相关矩阵获取 p 值。奇怪的是，当我对相同的数据使用 rcorr 时，出现以下错误：

Error in storage.mode(x) <- "double" : 
  (list) object cannot be coerced to type 'double'

有什么建议吗？

下面是我创建相关矩阵的代码（给出错误）：

library(Hmisc)

corr < rcffull[,c("liwc_WC","liwc_informal","liwc_male",
                   "liwc_female","liwccsr_csrdic","liwc_negemo",
                   "liwc_posemo","liwc_risk")]
rcorr(corr)

这个是有效的，但我没有得到 p 值：

cor(corr, use="complete.obs")

Answer 1

Hmisc::rcorr 期望输入是 matrix 并且不会自动转换数据帧，即使它们都是数字。因此，您应该能够根据您的输入调用 as.matrix()，例如

x <- c(-2, -1, 0, 1, 2)
y <- c(4,   1, 0, 1, 4)
z <- c(1,   2, 3, 4, NA)
v <- c(1,   2, 3, 4, 5)

df = data.frame(x, y, z, v)

# Fails with the same error as in the question
Hmisc::rcorr(df)
# Succeeds
Hmisc::rcorr(as.matrix(df))

rcorr 在 cor 完美工作的地方给出错误（需要相关矩阵的 p 值）

rcorr gives error where cor works perfectly (need p-values for correlation matrix)

r

correlation