检测 pandas 中值变化较小的 DataFrame 列中的异常值

Detecting outliers in a DataFrame column with small value changes in pandas

我正在处理一个列,该列的值在行之间应该有微小的变化。这些值是物理测量值,由于环境因素,测量值可能不正确,连续样本之间的增量非常高。变化率是一个被视为问题输入的数量,因为它可以改变以适应这种异常值检测的精度需求。

检测方法可以计算到目前为止所见值的平均值,并将离群值标记为高于其给定变化率的值,或者检查行之间的值变化并标记索引值,其中距离大于变化率和指数值,其中值 returned 低于可接受的变化率,相对于标记为异常值之前的第一个值。第一种方法可能更难,因为平均值应该根据正确的值计算,也就是说,标记为异常值的值不应被考虑到平均值的计算中。

正确的解决方案应该是 return 指示异常值的索引列表,然后将其用于将相应的值设置为 f.e。 NaN 或使用插值方法填充这些值。

例子

df = pd.DataFrame({'small_changing': [5.14, 5.18, 5.22, 5.18, 5.20, 5.17, 5.25, 5.55, 5.62, 5.78, 6.21, 6.13, 5.71, 5.35, 5.29, 5.24, 5.16, 5.18, 5.20, 5.15, 5.17, 5.00, 4.96, 4.88, 4.71, 4.65, 4.73, 4.79, 4.89, 4.92, 5.05, 5.11, 5.14, 5.17, 5.22, 5.24, 5.18, 5.20]})

假设变化率为0.15,假设第二种检测方法考虑了行之间的差异,则有两个异常值组需要检测。

第一组对应索引值[7, 12],因为行67相差0.3,高于0.15 限制,613 行之间的差异是 0.1,第 13 行是差异在 0.15 限制内的第一行.

第二组对应索引值[21, 29],因为行2021相差0.17,高于0.15 限制,2030 行之间的差异是 0.12,第 30 行是差异在 0.15 限制内的第一行.

此示例的结果:[7, 8, 9, 10, 11, 12, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29]

希望对您有所帮助。

我认为它不是 pythonic,但它有效:

def outlier_detection(points, limit):
    outliers_index = list()
    k=0
    for i in range(0,len(points)-1):
        if abs(points[i-k] - points[i+1]) >= limit:
            k+=1
            outliers_index.append(i+1)
        else:
            k=0
    return outliers_index

outlier_detection(df['small_changing'].values, 0.15)

OUT: [7, 8, 9, 10, 11, 12, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29]

这可能会节省处理大数据集上稀疏分布异常值的时间 -

def df_outlier(df, threshold=0.15):
    column = df.columns[0]
    df["outlier"] = False
    df_difference = df.copy()
    df_difference["difference"] = abs(df[column] - df[column].shift(1)).shift(-1)
    df_difference = df_difference.loc[df_difference["difference"] > threshold]
    for index in df_difference.index:
        row = df.loc[index]
        if not row["outlier"]:
            df_check = df[index+1:].copy()
            df_check["a_difference"] = abs(df_check[column] - row[column])
            df_check.loc[df_check["a_difference"] > threshold, "outlier"] = True
            df.loc[((df.index >= df_check.index[0]) & (df.index < df_check["outlier"].ne(True).idxmax())), "outlier"] = True

    return list(df.loc[df["outlier"] == True].index)

我正在使用这个。