使用 python 将数据从 csv 复制到 postgresql

Question

我在 windows 7 64 位。我有一个 csv 文件 'data.csv'。我想通过 python 脚本将数据导入 postgresql table 'temp_unicommerce_status'。

我的脚本是：

import psycopg2
conn = psycopg2.connect("host='localhost' port='5432' dbname='Ekodev' user='bn_openerp' password='fa05844d'")
cur = conn.cursor()
cur.execute("""truncate table "meta".temp_unicommerce_status;""")
cur.execute("""Copy temp_unicommerce_status from 'C:\Users\n\Desktop\data.csv';""")
conn.commit()
conn.close()

我遇到了这个错误

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\n\Documents\NetBeansProjects\Unicommerce_Status_Update\src\unicommerce_status_update.py", line 5, in <module>
cur.execute("""Copy temp_unicommerce_status from     'C:\Users\n\Desktop\data.csv';""")
psycopg2.ProgrammingError: must be superuser to COPY to or from a file
HINT:  Anyone can COPY to stdout or from stdin. psql's \copy command also works for anyone.

Answer 1

尝试以 root 用户身份执行相同的操作 - postgres。如果是 linux 系统，您可以更改文件的权限或将文件移动到 /tmp。问题是由于缺少从文件系统读取的凭据。

Answer 2

以下是相关 PostgreSQL 文档的摘录：带有文件名的 COPY 指示 PostgreSQL 服务器直接读取或写入文件。服务器必须可以访问该文件，并且必须从服务器的角度指定名称。当指定STDIN或STDOUT时，数据通过客户端和服务器之间的连接传输

这就是为什么对文件的 copy 命令仅限于 PostgreSQL 超级用户：文件必须存在于服务器上并且由服务器进程直接加载。

您应该改为使用：

cur.copy_from(r'C:\Users\n\Desktop\data.csv', temp_unicommerce_status)

如 this other answer 所建议，因为它在内部使用来自标准输入的 COPY。

Answer 3

使用copy_from cursor method

f = open(r'C:\Users\n\Desktop\data.csv', 'r')
cur.copy_from(f, temp_unicommerce_status, sep=',')
f.close()

文件必须作为对象传递。

由于您处理的是 csv 文件，因此有必要指定分隔符，因为默认为制表符

Answer 4

我解决这个问题的方法特别是使用 psychopg2 游标 class 函数 copy_expert（文档：http://initd.org/psycopg/docs/cursor.html）。 copy_expert 允许您使用 STDIN，因此无需为 postgres 用户授予超级用户权限。您对该文件的访问权限取决于客户端 (linux/windows/mac) 用户对该文件的访问权限

来自 Postgres COPY 文档 (https://www.postgresql.org/docs/current/static/sql-copy.html):

Do not confuse COPY with the psql instruction \copy. \copy invokes COPY FROM STDIN or COPY TO STDOUT, and then fetches/stores the data in a file accessible to the psql client. Thus, file accessibility and access rights depend on the client rather than the server when \copy is used.

您也可以严格保留访问 development_user 主文件夹和 App 文件夹的权限。

csv_file_name = '/home/user/some_file.csv'
sql = "COPY table_name FROM STDIN DELIMITER '|' CSV HEADER"
cursor.copy_expert(sql, open(csv_file_name, "r"))

Answer 5

您可以使用 d6tstack 使这变得简单

import d6tstack
import glob

c = d6tstack.combine_csv.CombinerCSV([r'C:\Users\n\Desktop\data.csv']) # single-file
c = d6tstack.combine_csv.CombinerCSV(glob.glob('*.csv')) # multi-file
c.to_psql_combine('postgresql+psycopg2://psqlusr:psqlpwdpsqlpwd@localhost/psqltest', 'tablename')

它还处理 data schema changes、create/append/replace table 并允许您使用 pandas.

预处理数据

Answer 6

我知道这个问题已经得到解答，但这是我的两分钱。我正在添加更多描述：

您可以使用cursor.copy_from方法：

首先，您必须创建一个 table 列数与您的 csv 文件相同的文件。

示例：

我的 csv 看起来像这样：

Name,       age , college , id_no , country , state   , phone_no

demo_name   22  , bdsu    , 1456  , demo_co , demo_da , 9894321_

先创建一个table:

import psycopg2
from psycopg2 import Error

connection = psycopg2.connect(user = "demo_user",
                                  password = "demo_pass",
                                  host = "127.0.0.1",
                                  port = "5432",
                                  database = "postgres")
cursor = connection.cursor()


create_table_query = '''CREATE TABLE data_set
(Name  TEXT NOT NULL ,
age  TEXT NOT NULL ,
college  TEXT NOT NULL ,
id_no TEXT NOT NULL ,
country TEXT NOT NULL ,
state TEXT NOT NULL ,
phone_no TEXT NOT NULL);'''

cursor.execute(create_table_query)
connection.commit()

现在您可以在需要三个参数的地方简单地使用 cursor.copy_from :

first file object , second table_name , third sep type

您现在可以复制了:

f = open(r'final_data.csv', 'r')
cursor.copy_from(f, 'data_set', sep=',')
f.close()

完成

Answer 7

我将 post 我运行在尝试将 csv 文件复制到基于 linux 的系统上的数据库时遇到的一些错误....

这是一个示例 csv 文件：

Name Age Height
bob  23   59
tom  56   67

您必须安装库 psycopg2（即 pip install psycopg2 或 sudo apt install python3-psycopg2）
您必须在系统上安装 postgres 才能使用 psycopg2 (sudo apt install postgresql-server postgresql-contrib )
现在您必须创建一个数据库来存储 csv，除非您已经使用 pre-existing 数据库
设置了 postgres

使用 Postgres 命令复制 CSV

安装 postgres 后，它会创建一个默认用户帐户，让您可以访问 postgres 命令
切换到postgres账号问题：sudo -u postgres psql
通过发出以下命令访问提示：psql

#创建数据库的命令创建数据库mytestdb； #连接到数据库创建一个table \连接我的测试数据库； #create a table 具有相同的 csv 列名创建 table 测试（姓名字符（50），年龄字符（50），身高字符（50））； #复制csv文件到table 用 csv header;
复制 mytestdb 'path/to/csv'

使用 PYTHON 复制 CSV 我运行将 CSV 文件复制到数据库的主要问题是我还没有创建数据库，但是这仍然可以通过 python 完成。

import psycopg2 #import the Postgres library

#connect to the database
conn = psycopg2.connect(host='localhost',
                       dbname='mytestdb',
                       user='postgres',
                       password='')  
#create a cursor object 
#cursor object is used to interact with the database
cur = conn.cursor()

#create table with same headers as csv file
cur.execute('''create table test(name char(50), age char(50), height char(50));''')

#open the csv file using python standard file I/O
#copy file into the table just created 
f = open('file.csv','r')
cursor.copy_from(f, 'test', sep=',')
f.close()

Answer 8

#sample of code that worked for me

import psycopg2 #import the postgres library

#connect to the database
conn = psycopg2.connect(host='localhost',
                       dbname='database1',
                       user='postgres',
                       password='****',
                       port='****')  
#create a cursor object 
#cursor object is used to interact with the database
cur = conn.cursor()

#create table with same headers as csv file
cur.execute("CREATE TABLE IF NOT EXISTS test(**** text, **** float, **** float, **** 
text)")

#open the csv file using python standard file I/O
#copy file into the table just created 
with open('******.csv', 'r') as f:
next(f) # Skip the header row.
    #f , <database name>, Comma-Seperated
    cur.copy_from(f, '****', sep=',')
    #Commit Changes
    conn.commit()
    #Close connection
    conn.close()


f.close()

使用 python 将数据从 csv 复制到 postgresql

copy data from csv to postgresql using python

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postgresql

psycopg2

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