SparkR filterRDD 和 flatMap 不工作

Question

在花了很长时间研究如何安装 SparkR 之后，我认为该软件包可能存在一些问题...

请记住，我是 spark 的新手，所以不确定我是否做对了。

我从新的 EC2 ubuntu 64 位实例安装了 R 和 JDK

我 git 克隆了 apache spark 存储库并构建了它：

git clone https://github.com/apache/spark.git
cd spark
build/mvn -DskipTests -Psparkr package

然后我更改了我的 .Rprofile 以通过包含以下行来引用 R 目录....

Sys.setenv(SPARK_HOME="/home/ubuntu/spark")
.libPaths(c(file.path(Sys.getenv("SPARK_HOME"), "R", "lib"), .libPaths()))

然后在启动 R 后，我尝试运行通过给出的快速入门指南 here

以下是我采取的以下步骤...

 R> library(SparkR)
 R> sc <- sparkR.init(master="local")
 R> textFile <- SparkR:::textFile(sc, "/home/ubuntu/spark/README.md")
 R> cc <- SparkR:::count(textFile)
 R> t10 <- SparkR:::take(textFile,10)

到这里为止一切正常...下面的行不起作用...

 R> SparkR:::filterRDD(textFile, function(line){ grepl("Spark", line)})
 Error: class(objId) == "jobj" is not TRUE

 R> traceback()
 7: stop(sprintf(ngettext(length(r), "%s is not TRUE", "%s are not all TRUE"), 
   ch), call. = FALSE, domain = NA)
 6: stopifnot(class(objId) == "jobj")
 5: callJMethod(object@jrdd, "toString")
 4: paste(callJMethod(object@jrdd, "toString"), "\n", sep = "")
 3: cat(paste(callJMethod(object@jrdd, "toString"), "\n", sep = ""))
 2: function (object) 
    standardGeneric("show")(x)
 1: function (object) 
    standardGeneric("show")(x)

下面是另一个不起作用的示例。

 R> SparkR:::flatMap(textFile,
         function(line) {
            strsplit(line, " ")[[1]]
               })
  Error: class(objId) == "jobj" is not TRUE

以下是我的会话信息...

 R> > sessionInfo()
 R version 3.2.0 (2015-04-16)
 Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
 Running under: Ubuntu 14.04.2 LTS

 locale:
  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
 [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

 attached base packages:
 [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

 other attached packages:
 [1] SparkR_1.4.0

如有任何帮助，我们将不胜感激....

Answer 1

所以这实际上是 SparkR 中 RDD 的显示方法中的一个错误，我已经在 https://issues.apache.org/jira/browse/SPARK-7512

中记录了这个

但是这个错误应该不会以任何方式影响您的计算。因此，如果您改用

filteredRDD <- SparkR:::filterRDD(textFile, function(line){ grepl("Spark", line)})

然后错误消息应该消失

SparkR filterRDD 和 flatMap 不工作

SparkR filterRDD and flatMap not working

java

scala

r

amazon-ec2

apache-spark