如何找到每组 r 中连续 n 天的平均值

Question

我有一个包含 id（包含重复项）、日期（包含重复项）、值的数据框。这些值是针对不同的连续日期记录的。现在我想要的是用 id 和日期（连续 n 天）对数据框进行分组并找到平均值。 return NA 如果最后一组不包含 n 天。

id  date          value
 1  2016-10-5       2
 1  2016-10-6       3
 1  2016-10-7       1
 1  2016-10-8       2
 1  2016-10-9       5
 2  2013-10-6       2
 .  .               .
 .  .               .
 .  .               .
 20 2012-2-6        10

连续 n 天的期望输出为 3

  id  date      value  group_n_consecutive_days     mean_n_consecutive_days
   1  2016-10-5  2         1                        2
   1  2016-10-6  3         1                        2
   1  2016-10-7  1         1                        2
   1  2016-10-8  2         2                        NA
   1  2016-10-9  5         2                        NA
   2  2013-10-6  2         1                        4
   .
   .
   .
   .
    20 2012-2-6  10         6                       25

Answer 1

问题中的数据在 id 内排序且连续，因此我们假设是这种情况。此外，当问题涉及重复日期时，我们假设这意味着不同的 id 值可以具有相同的日期，但在 id 中，日期是唯一且连续的。现在，使用 id 末尾注释 2 中可重复显示的数据，并使用 gl 计算组数。然后按 id 和 group_no 分组取每组 3 的平均值或 NA 对于较小的组。

library(dplyr)

DF %>% 
  group_by(id) %>%
  mutate(group_no = c(gl(n(), 3, n()))) %>%
  group_by(group_no, add = TRUE) %>%
  mutate(mean = if (n() == 3) mean(value) else NA) %>%
  ungroup

给予：

# A tibble: 6 x 5
     id date       value group_no  mean
  <int> <date>     <int>    <int> <dbl>
1     1 2016-10-05     2        1     2
2     1 2016-10-06     3        1     2
3     1 2016-10-07     1        1     2
4     1 2016-10-08     2        2    NA
5     1 2016-10-09     5        2    NA
6     2 2013-10-06     2        1    NA

注一

gl(...) 的替代方案可以是 cumsum(rep(1:3, length = n()) == 1) 而 if (n() = 3) mean(value) else NA 的替代方案可以是 mean(head(c(value, NA, NA), 3)) .

注2

假定可重现形式的输入数据为：

Lines <- "id  date          value
 1  2016-10-5       2
 1  2016-10-6       3
 1  2016-10-7       1
 1  2016-10-8       2
 1  2016-10-9       5
 2  2013-10-6       2"
DF <- read.table(text = Lines, header = TRUE)
DF$date <- as.Date(DF$date)

如何找到每组 r 中连续 n 天的平均值

How to find mean of n consecutive days in each group r

group-by

r

plyr

lubridate

dplyr

注一

注2