使用 PIL TiffTags 从 .tif 图像元数据中提取比例尺

Question

我是 Python 的新手，我希望从电子显微镜 (.tif) 图像中提取比例信息。

当我在记事本中打开文件并滚动到底部时，我看到一个标题“[Scan]”和它下面的一个项目 "PixelWidth=3.10059e-010"。

我想在 Python 中读取此值并将其用作测量图像内物理距离的校准因子。

我发现了一种使用 PIL () 的有前途的方法，但是在运行推荐代码时遇到错误。

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS

with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

我希望这会创建一个 object "meta_dict"，其中包含 "PixelWidth" 之类的字符串和“3.10059e-010”之类的浮点数。

相反，我看到了：

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <module>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <dictcomp>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

KeyError: 34682

显然我做错了什么。任何帮助将不胜感激。谢谢！

Answer 1

使用PIL，我认为使用for循环来设置你的字典，然后打印想要的结果会更清楚。

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS


with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {}
    for key in img.tag:      # don't really need iterkeys in this context
        meta_dict[TAGS.get(key,'missing')] = img.tag[key]

# Now you can print your desired unit:

print meta_dict["PixelWidth"]

如果您只需要一个值，您也可以通过以下方式查找 PixelWidth 标签的编号：

for k in img.tag:
     print k,TAGS.get(k,'missing')

然后只打印 img.tag[<thatnumber>] 而不填充字典。

Answer 2

看起来您的文件可能是 FEI SEM TIFF，其中包含 TIFF 标签 34682 中类似 INI 的元数据。

尝试使用 tifffile:

import tifffile
with tifffile.TiffFile('FEI_SEM.tif') as tif:
    print(tif.fei_metadata['Scan']['PixelWidth'])

使用 PIL TiffTags 从 .tif 图像元数据中提取比例尺

Extracting scale bar from .tif image metadata using PIL TiffTags

python

tiff

metadata

python-imaging-library