使用 r 自动选择 .csv 文件中的行和列

Question

所以我为我的论文创建了一个数据库，我想比较不同情况下的物质以获得 P 值。为了做到这一点，我在 R 中创建了一个脚本，它不是自动的。我对如何使用 for 循环创建脚本来执行此操作非常感兴趣。我想 select 为每一行分组，也为每三列分组。

如果可行，请告诉我。提前致谢！

现在我就是这样做的。首先 select 第 1 行的前三个值，然后 select 第一行的下三个值，以便在下一步中比较它们。

row1_1 <- my_data[1, 2:4]
row1_2 <- my_data[1, 6:8]

Answer 1

下面将根据问题使用for循环遍历每一行

for (i in 1:nrow(my_data))
{

case1<- my_data[i, 2:4]
case2<- my_data[i, 6:8]
compare_cases <- t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) 
print(case1)
print(case2)
print(compare_cases)
}

根据评论修改了带有错误处理的变体

pvalues <- c()
for (i in 1:nrow(my_data))
{

  case1<- my_data[i, 2:4]
  case2<- my_data[i, 6:8]
  pval <- NA
  test <- tryCatch({ t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) }, 
                     warning = function(war) { NA },
                     error = function(err) { NA },
                     finally = { })
  print(paste0("Test for row i=",i))
  print(test)
  if (identical(test,NA)) pval <- NA
  else pval <- test$p.value

  pvalues <- c(pvalues,pval)
}

print("All my pvalues for all rows are:")
print(pvalues)

使用 r 自动选择 .csv 文件中的行和列

Selecting rows and columns within .csv file automatically using r

compare

r

dataframe

p-value