在 base R 中翻转热图的颜色范围

Question

我正在 base R 中构建一个简单的热图。这是我的矩阵：

stleft = matrix( 
     c(0,5,5,2,6,8,4,6,9), 
     nrow=3, 
     ncol=3) 
colnames(stleft) <- c("Narrow","Wide", "Wider")
rownames(stleft) <- c("Person", "Object","Bare")
stleft

矩阵如下所示：

> stleft
       Narrow Wide Wider
Person      0    2     4
Object      5    6     6
Bare        5    8     9

要构建热图，我只需运行:

heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none")

如您所见，“0”（对应于 narrow/person 单元格）显示为深红色，而“9”（对应于 wider/bare 单元格）显示为浅黄色。

如何"flip"这个范围，让“0”出现在浅色，“9”出现在深色？
为什么图片 t运行？它在 RStudio 绘图面板中显示为 t运行cated，并在 t运行cated 中保存。我曾尝试在 R Studio 中放大绘图面板，但无济于事。

Answer 1

heatmap()（和image()）默认使用heat.colors()生成颜色。如果需要，您可以提供自己的颜色，f.ex。通过使用 heat.colors()，正好相反。

par(oma=c(3, 0, 0, 3))
col <- rev(heat.colors(999))
heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none", col = col)

在 base R 中翻转热图的颜色范围

Flip color range of heatmap in base R

r

colors

heatmap