如何在一个图中叠加多个绘图类型（条形图 + 散点图），共享 x 轴

Question

我正在尝试叠加两个图形，一个条形图和一个散点图，它们共享一个 x 轴，但在图形的两侧都有单独的 y 轴。我尝试过使用 matplotlib、ggplot 和 seaborn，但我都遇到了同样的问题。我可以分别绘制它们，并且它们绘制正确，但是当我尝试将它们一起绘制时，条形图是正确的，但是散点图中只显示了几个数据点。我放大了，可以确认几乎 none 的散点图点出现了。

这是我的代码。我已经加载了一个 pandas 数据框，并试图将 'dKO_Log2FC' 绘制为条形图，将 'TTCAAG' 绘制为散点图。它们在 x 轴上共享 'bin_end' 位置。如果我注释掉 sns.barplot，则散点图非常完美。如果我注释掉 sns.scatterplot，条形图也是如此。当我将它们一起绘制而不注释掉时，条形图图，但只显示 'TTCAAG' 列中的两个数据点。我玩过散点的大小，放大等等，但没有任何效果。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
import pandas as pd

file = pd.read_csv('path/to/csv_file.csv')
df = pd.DataFrame(file, columns=['bin_end', 'TTCAAG', 'dKO_Log2FC'])

bin_end = df['bin_end']
TTCAAG = df['TTCAAG']
dKO_Log2FC = df['dKO_Log2FC']

fig, ax = plt.subplots()
ax2 = ax.twinx()

sns.barplot(x=bin_end, y=dKO_Log2FC, ax=ax, color="blue", data=df)

sns.scatterplot(x=bin_end, y=TTCAAG, ax=ax2, color="red", data=df)

plt.title('Histone Position in TS559 vs dKO')
plt.xlabel('Genomic Position (Bin = 1000nt)', fontsize=10)
plt.xticks([])
plt.ylabel('Log2 Fold Change', fontsize=10)

plt.show()

我不知道为什么散点图不能完全绘制出来。数据集非常大，但即使我将其分解成更小的部分，也只会显示几个散点。这是图表

Answer 1

我不确定是什么问题，我认为是与数据量或其他一些与数据相关的问题，但是由于您可以单独绘制数据，因此可以为每个图生成一个图像并然后混合两个图像以获得所需的图。

import numpy as np
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
from PIL import Image

npoints=200
xRange=np.arange(0,npoints,1)
randomdata0=np.abs(np.random.normal(0,1,npoints))
randomdata1=np.random.normal(10,1,npoints)
axtick=[7,10,14]
ax2tick=[0,1.5,3]

fig0=plt.figure(0)
ax=fig0.gca()
ax2=ax.twinx()
sns.scatterplot(x=xRange,y=randomdata1,ax=ax)
ax.set_yticks(axtick)
ax.set_ylim([6,15])
ax2.set_yticks(ax2tick)
ax2.set_ylim([0,3.5])
plt.xticks([])

canvas0 = FigureCanvas(fig0)
s, (width, height) = canvas0.print_to_buffer()
X0 = Image.frombytes("RGBA", (width, height), s) #Contains the data of the first plot

fig1=plt.figure(1)
ax=fig1.gca()
ax2=ax.twinx()
sns.barplot(x=xRange,y=randomdata0,ax=ax2)
ax.set_yticks(axtick)
ax.set_ylim([6,15])
ax2.set_yticks(ax2tick)
ax2.set_ylim([0,3.5])
plt.xticks([])

canvas1 = FigureCanvas(fig1)
s, (width, height) = canvas1.print_to_buffer()
X1 = Image.frombytes("RGBA", (width, height), s) #Contains the data of the second plot

plt.figure(13,figsize=(10,10))
plt.imshow(Image.blend(X0,X1,0.5),interpolation='gaussian')
Axes=plt.gca()
Axes.spines['top'].set_visible(False)
Axes.spines['right'].set_visible(False)
Axes.spines['bottom'].set_visible(False)
Axes.spines['left'].set_visible(False)
Axes.set_xticks([])
Axes.set_yticks([])

请记住在两个图中将双轴设置为相同的范围和刻度，否则，图像会有一些偏移并且数字不会对齐。希望对你有帮助

如何在一个图中叠加多个绘图类型（条形图 + 散点图），共享 x 轴

How do I overlay multiple plot types (bar + scatter) in one figure, sharing x-axis

python

plot

visualization

matplotlib

seaborn