python/networkx 有向图中的单独边箭头

Question

我想获得类似这样的东西：

使用 python 库 networkx。我可以使用以下代码生成类似的有向图：

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.DiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

nx.draw(G, node_color='w', edgecolors='k', width=2.0, with_labels=True)
plt.show()

产生：

但是，节点3和节点4之间的箭头是叠加的，看起来只是一个有两个头的箭头。是否可以将它们稍微分开，以便更清楚地表明那里有两条边，而不仅仅是一条边？（我知道可以使用 pygraphviz 来完成，但我正在尝试使用 matplotlib 来完成）。

Answer 1

两个节点之间的多条边需要 MultiDiGraph：

G = nx.MultiDiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

要可视化网络，您可以使用显示平行边的 Graphviz。您可以在 dot 中编写图表并使用 graphviz.Source:

显示图表

from networkx.drawing import nx_pydot
from graphviz import Source

nx_pydot.write_dot(G, 'multig.dot')
Source.from_file('multig.dot')

Answer 2

我前段时间分叉了 networkx 绘图实用程序来解决这个问题和我遇到的其他几个问题。该包名为 netgraph，支持绘制 networkx 和 igraph 图结构（以及简单的边列表）。它在引擎盖下使用 matplotlib，并公开创建的艺术家，以便即使没有内置功能也可以轻松地进一步操作它们。

#!/usr/bin/env python

"""

"""

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
import netgraph

G = nx.DiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

netgraph.draw(G, node_color='w', edge_color='k', edge_width=2.0, node_labels={str(ii) : str(ii) for ii in range(1,5)})
plt.show()

python/networkx 有向图中的单独边箭头

Separate edge arrows in python/networkx directed graph

python

matplotlib

networkx