从加权边列表创建有向加权网络图

Question

我有以下存储在 edgelist.txt 中的边缘列表：

soldier1, soldier2, 3
soldier1, soldier3, 1
soldier1, soldier4, 2
soldier2, soldier1, 2
soldier2, soldier3, 1
soldier2, soldier4, 3
soldier3, soldier1, 3
soldier3, soldier2, 2
soldier3, soldier4, 1
soldier4, soldier1, 2
soldier4, soldier2, 1
soldier4, soldier3, 3

为了绘制图形，我使用了以下代码：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

G = nx.read_weighted_edgelist(path='edgelist.txt', delimiter=',', create_using=nx.DiGraph())
nx.draw_networkx(G, with_labels=True, arrowsize=5, pos=nx.spring_layout(G))
limits=plt.axis('off')
plt.show()

但是，它正在创建一个节点数量翻倍的图表（应该只有 4 个，但它创建的图表有 8 个。）当您查看图表的绘图时，这一点很明显：

这是图表信息：

Name: 
Type: DiGraph
Number of nodes: 8
Number of edges: 12
Average in degree:   1.5000
Average out degree:   1.5000

边数正确，但节点数加倍。我该如何解决这个问题？

Answer 1

由于您将 , 指定为分隔符，因此空白字符被视为名称的一部分。
因此，您最终会得到每个节点的两个节点 ' soldierN' 和 'soldierN'。

您可以更改分隔符以同时考虑空格，即从 ',' 到 ', '

>>> G = nx.read_weighted_edgelist(path='edgelist.txt', delimiter=', ', create_using=nx.DiGraph())
>>> G.nodes()
['soldier1', 'soldier2', 'soldier3', 'soldier4']

从加权边列表创建有向加权网络图

Creating a directed, weighted network graph from weighted edgelist

python

matplotlib

networkx