Follow-up 在 Dash/Plotly 中显示属性会导致 KeyError

Question

在对我的进行了有用的回答后，我决定使用内部数据（我无法在此处共享）。内部数据遵循与模拟数据相同的格式。我只是将数据复制到同一个工作目录，确保新数据具有相同的格式，即相同的列 headers，等等。我使用 DiffChecker 来确保 app.py（来自我原来的post) 匹配概念验证 (appPOC.py)。内部数据有600多个节点，3000多条边

制作交互式仪表板的代码与我用于的代码相同。但是，这次我运行变成了这个 KeyError:

Traceback (most recent call last):
  File "appPOC.py", line 75, in <module>
    hovertext = "Document Description: " + str(G.nodes[node]['Description']) + "<br>" + "Document Name: " + str(G.nodes[node]['DocName']) + "<br>" + "Document ID: " + str(G.nodes[node]['DocumentID'])
KeyError: 'Description'

数据本身应该没问题，因为我可以在节点旁边没有悬停文本的情况下绘制网络。

总结一下：app.py可以绘制模拟数据，appPOC.py（相同，但文件名不同）不能绘制内部数据。这让我相信 CSV 文件中的内部数据有问题。

编辑: 我发现如果元素中没有列出目标，则无法绘制图形。如果元素中未定义（目标）节点，是否有自动创建节点（如在 Gephi 中）？

Answer 1

NetworkX 为每条边的起始节点和终止节点创建节点。因此，

G = nx.from_pandas_edgelist(edges, 'Source', 'Target')

你的图有所有可能的节点。然而，

nx.set_node_attributes(G, nodes.set_index('Doc')['Description'].to_dict(), 'Description')
nx.set_node_attributes(G, nodes.set_index('Doc')['DocumentID'].to_dict(), 'DocumentID')

您只需为节点数据框中的节点属性填写 'Description' 和 'DocumentID'。一个简单的解决方法是替换

str(G.nodes[node]['Description'])

和

str(G.nodes[node].get('Description', ''))

'DocName' 和 'DocumentID' 也类似。有关 get 方法的更多信息，请访问：Why dict.get(key) instead of dict[key]? 基本上，我们使用 networkx 使用 dict 来存储值并使用 get 方法，它允许提供默认值。

一个简单的可重现的最小示例

import networkx as nx
g = nx.karate_club_graph()
# all nodes in this graph have the node attribute 'club' filled
# we add a node without this node attribute
g.add_node("Test")
print(g.nodes[0]["club"])
# 'Mr. Hi'
# print(g.nodes["Test"]["club"]
# results in KeyError: 'club'
print(g.nodes["Test"].get("club", ""))
# ''

Follow-up 在 Dash/Plotly 中显示属性会导致 KeyError

Follow-up to Displaying attributes in Dash/Plotly results in KeyError

python

networkx

一个简单的可重现的最小示例