使用 Networkx 可视化大图
Visualize large graph with Networkx
我有一个 node1、node2 形式的数据集,想用网络构建一个图。这是一个相当大的数据集,导致具有 500k 个节点的图
import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx
df = pd.read_csv('large.csv')
G=nx.from_pandas_edgelist(df, 'node1','node2')
这部分代码运行速度非常快,可以将数据帧转换为图形。然后我尝试应用 spring 布局:
pos = nx.spring_layout(G)
这部分代码需要永远。如果我尝试不同的布局,如 circular_layout 或 shell_layout,它会非常快,但布局适合我的图表。
对于这么大的图,有更好的方法来应用spring_layout吗?
对于这么大的图,我不建议使用 networkx
来可视化这么大的图。备选方案是 graphviz
或 Gephi
。
查看以下相关问题列表:
- Huge Graph Visualization
- Visualize big graphs
- Visualizing Undirected Graph That's Too Large for GraphViz?
- Software for visualizing very large graphs
- How to visualize large graph?
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import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx
df = pd.read_csv('large.csv')
G=nx.from_pandas_edgelist(df, 'node1','node2')
这部分代码运行速度非常快,可以将数据帧转换为图形。然后我尝试应用 spring 布局:
pos = nx.spring_layout(G)
这部分代码需要永远。如果我尝试不同的布局,如 circular_layout 或 shell_layout,它会非常快,但布局适合我的图表。
对于这么大的图,有更好的方法来应用spring_layout吗?
对于这么大的图,我不建议使用 networkx
来可视化这么大的图。备选方案是 graphviz
或 Gephi
。
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