在 R 包中查找 Rcpp 函数

Question

我想打印R包frailtysurv中bh函数的C代码。所以我输入：

> frailtySurv:::bh
function (d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, 
    weights, abstol, reltol, maxit) 
{
    .Call("_frailtySurv_bh", PACKAGE = "frailtySurv", 
        d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, 
        weights, abstol, reltol, maxit)
}
<bytecode: 0x0000025263262be0>
<environment: namespace:frailtySurv>

相应 Github 页面顶部出现此警告：

# Generated by using Rcpp::compileAttributes() -> do not edit by hand

但后来我在 'frailtySurv' 库中找不到 src 文件，也没有在其他文件中找到 _frailtySurv_bh 函数。包源中没有任何 .Rcpp 函数的踪迹。我知道类似的问题已经被问过几次（例如：here, here or here 等）来打印 .Call 调用的函数。这些对我的情况没有帮助。

关于在哪里可以找到 _frailtySurv_bh 函数的提示？

谢谢 :-)

Answer 1

_frailtySurv_bh 函数在 RcppExports.cpp 文件中定义，定义为 here，如下所示：

RcppExport SEXP _frailtySurv_bh(SEXP d_SEXP, SEXP R_starSEXP, SEXP K_SEXP, SEXP Y_SEXP, SEXP N_SEXP, SEXP N_dotSEXP, SEXP betaSEXP, SEXP thetaSEXP, SEXP frailtySEXP, SEXP weightsSEXP, SEXP abstolSEXP, SEXP reltolSEXP, SEXP maxitSEXP) {
BEGIN_RCPP
    Rcpp::RObject rcpp_result_gen;
    Rcpp::RNGScope rcpp_rngScope_gen;
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type d_(d_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type R_star(R_starSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type K_(K_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type Y_(Y_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type N_(N_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type N_dot(N_dotSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type beta(betaSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type theta(thetaSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< String >::type frailty(frailtySEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type weights(weightsSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< double >::type abstol(abstolSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< double >::type reltol(reltolSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< int >::type maxit(maxitSEXP);
    rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(bh(d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, weights, abstol, reltol, maxit));
    return rcpp_result_gen;
END_RCPP
}

您会看到它实际上是一个名为 bh 的 C++ 函数的非常薄的包装器，它有点太长而无法在此处重现，但被定义为 here.

在 R 包中查找 Rcpp 函数

Find Rcpp function in a R package

c++

r

package

rcpp