yaml::yaml.load(..., eval.expr = TRUE) 错误：在 Rmarkdown 中使用闪亮时

Question

我无法用 shiny 编译任何 .Rmd 文件。例如，此 five-line 文档（或任何文档，例如使用 File->New File -> R Markdown ... : Shiny Document 创建的文档）

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title: "Untitled"
output: flexdashboard::flex_dashboard
runtime: shiny
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End of my very short document.

单击“运行文档”按钮时出现此错误：

==> rmarkdown::run('/home/gxd/R-codes/lesson10/tmp.Rmd', shiny_args = list(launch.browser = FALSE), auto_reload = FALSE, dir = '/home/gxd/R-codes/lesson10',  render_args = list(encoding = 'UTF-8'));
Error in yaml::yaml.load(..., eval.expr = TRUE) : 
  Scanner error: while scanning a quoted scalar at line 2, column 8 found unexpected end of stream at line 8, column 15
Calls: <Anonymous> ... parse_yaml_front_matter -> yaml_load -> <Anonymous>
Execution halted

遵循此建议： RMarkdown error in YAML 我检查了 YAML header 中的所有空格和其他特殊符号。一切似乎都是正确的。

有谁知道是什么原因造成的以及如何解决？我的 session 信息如下：

> sessionInfo()
R version 3.6.1 (2019-07-05)
...
>   packageVersion("shiny") 
[1] ‘1.5.0’
>   packageVersion("rmarkdown") 
[1] ‘2.3’
>   packageVersion("knitr") 
[1] ‘1.28’

Answer 1

我发现如果我创建新项目，然后用 Shiny 创建一个新的 R Markdown 文件，那么编译就很好了。

我一定是我以前的项目目录中的某个东西阻止了我的 .Rmd 编译带有闪亮的文件。我那里确实有很多其他文件（包括其他带有闪亮的 .Rmd，none 已编译）和各种 sub-directories（我也有带有闪亮的 .Rmd 文件，以及它们编译的地方）。

但我仍然没有弄清楚到底是什么导致了这个问题。我试图删除 ./Rproj.user 和 .Rhistory - 它没有任何效果。

所以我创建了一个新的干净目录并放入上面显示的简单 5 行 .Rmd 文件并编译。

我仍然很好奇问题出在哪里...

更新：
现在我知道问题出在哪里了！ - 在同一目录中，我有另一个不相关的“未完成”.Rmd 文件。这个另一个 .Rmd 文件有 YAML header，标题中有未完成的（打开的）字符串：

title: "The Header of another Rmd file that was in the same directory

请注意，结尾缺少标题 "。

修复后，我现在可以在同一目录中编译任何其他 .Rmd。
但如果我不修复它，我将不会在同一目录中编译任何其他 .Rmd！那;有点奇怪，但就是这样。

yaml::yaml.load(..., eval.expr = TRUE) 错误：在 Rmarkdown 中使用闪亮时

Error in yaml::yaml.load(..., eval.expr = TRUE) : when using shiny in Rmarkdown

knitr

r-markdown

shiny