如何使用来自不同目录的 scripts/functions 编写 docker 文件 运行 一个 python 脚本
How to write a docker file running a python script using scripts/functions from different directory
我正在为来自 bitbucket 的 运行ning 一个 python 程序写一个 docker 脚本，比方说 myprogram.py。 python 程序使用其他目录中其他文件的特定函数，并像这样调用它们：
from mydirectory.myfunction import MyFunction
通常情况下，如果我只是克隆 bitbucket 存储库并 运行 它，不会发生错误。
我在 bitbucket 中的回购包括程序、一个 docker 文件和一些带有函数脚本的目录。所以我克隆了 repo，然后构建。
当我尝试构建它时，它成功了。我用这个命令构建它：
docker build -t myprogram .
但是，当我使用命令时（-h 是用 argparse 制作的“帮助”选项，只是为了查看程序是否能够 运行 使用选项）：
docker run --rm -it myprogram -h
它给了我错误：
Traceback (most recent call last):
File "/usr/src/myprogram.py", line 8, in <module>
from mydirectory.myfunction import MyFunction
ImportError: No module named 'mydirectory'
在 docker 文件中实现该程序使用 bitbucket 同一存储库中其他目录中其他脚本的函数的最佳方法是什么？我是 docker 的新手，如有任何帮助，我们将不胜感激！如果您需要任何其他信息，请告诉我。
我的 docker 文件如下所示：
FROM debian:stretch
ENV DEBIAN_FRONTEND noninteractive
RUN apt-get update -qq; \
apt-get install -y -qq git \
apt-utils \
wget \
python3-pip \
ncbi-blast+ \
libz-dev \
; \
rm -rf /var/cache/apt/* /var/lib/apt/lists/*;
ENV DEBIAN_FRONTEND Teletype
# Install python dependencies
RUN pip3 install -U numpy
COPY myprogram.py /usr/src/myprogram.py
RUN mkdir /mydirectory
COPY mydirectory/* /mydirectory/
RUN chmod 755 /usr/src/myprogram.py; \
WORKDIR /workdir
# Execute program when running the container
ENTRYPOINT ["/usr/src/myprogram.py"]
问题是您正在将 mydirectory 复制到 / 而您的脚本位于 /usr/src。默认情况下，python 仅在 site-packages 目录和脚本所在的目录中查找包（当前工作目录用作备用，以防脚本位置不可用）。因此，您应该将 mydirectory 复制到与脚本相同的目录中（即 /usr/src）。因此，您有两种方法可以继续前进：
- 将
mydirectory复制到/usr/src（您可以将其作为工作目录）。
- 在脚本中操纵 sys.path 以包含
mydirectory. 的绝对路径
为此，只需在导入之前将此代码段放入脚本中即可 mydirectory
import sys
sys.path.append('/')
del sys # If you don't need it anywhere else
from mydirectory.myfunction import MyFunction
您可能需要查看 sys.path 文档。
我正在为来自 bitbucket 的 运行ning 一个 python 程序写一个 docker 脚本，比方说 myprogram.py。 python 程序使用其他目录中其他文件的特定函数，并像这样调用它们：
from mydirectory.myfunction import MyFunction
通常情况下，如果我只是克隆 bitbucket 存储库并 运行 它，不会发生错误。
我在 bitbucket 中的回购包括程序、一个 docker 文件和一些带有函数脚本的目录。所以我克隆了 repo，然后构建。
当我尝试构建它时，它成功了。我用这个命令构建它：
docker build -t myprogram .
但是，当我使用命令时（-h 是用 argparse 制作的“帮助”选项，只是为了查看程序是否能够 运行 使用选项）：
docker run --rm -it myprogram -h
它给了我错误：
Traceback (most recent call last):
File "/usr/src/myprogram.py", line 8, in <module>
from mydirectory.myfunction import MyFunction
ImportError: No module named 'mydirectory'
在 docker 文件中实现该程序使用 bitbucket 同一存储库中其他目录中其他脚本的函数的最佳方法是什么？我是 docker 的新手，如有任何帮助，我们将不胜感激！如果您需要任何其他信息，请告诉我。
我的 docker 文件如下所示：
FROM debian:stretch
ENV DEBIAN_FRONTEND noninteractive
RUN apt-get update -qq; \
apt-get install -y -qq git \
apt-utils \
wget \
python3-pip \
ncbi-blast+ \
libz-dev \
; \
rm -rf /var/cache/apt/* /var/lib/apt/lists/*;
ENV DEBIAN_FRONTEND Teletype
# Install python dependencies
RUN pip3 install -U numpy
COPY myprogram.py /usr/src/myprogram.py
RUN mkdir /mydirectory
COPY mydirectory/* /mydirectory/
RUN chmod 755 /usr/src/myprogram.py; \
WORKDIR /workdir
# Execute program when running the container
ENTRYPOINT ["/usr/src/myprogram.py"]
问题是您正在将 mydirectory 复制到 / 而您的脚本位于 /usr/src。默认情况下，python 仅在 site-packages 目录和脚本所在的目录中查找包（当前工作目录用作备用，以防脚本位置不可用）。因此，您应该将 mydirectory 复制到与脚本相同的目录中（即 /usr/src）。因此，您有两种方法可以继续前进：
- 将
mydirectory复制到/usr/src（您可以将其作为工作目录）。 - 在脚本中操纵 sys.path 以包含
mydirectory. 的绝对路径
为此，只需在导入之前将此代码段放入脚本中即可 mydirectory
import sys
sys.path.append('/')
del sys # If you don't need it anywhere else
from mydirectory.myfunction import MyFunction
您可能需要查看 sys.path 文档。