Linux 缺少 GROMACS 的 Doxygen 可执行文件
Missing Doxygen Executable for GROMACS on Linux
我正尝试在 Linux 上为我的硕士项目安装 GROMACS。我已按照本指南中给出的说明进行操作 https://github.com/rehanzfr/MDSimulations/blob/master/README.md,我已经接近最后一步了,运行 行:
sudo cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=OFF -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=OFF -DCMAKE_C_COMPILER=gcc -DREGRESSIONTEST_PATH=/home/username/Downloads/GromacsDownload/regressiontests-2020
然而,我在最后的障碍中倒下了,我得到了错误:
-- Doxygen not found. Documentation targets will not be generated.
CMake Error at tests/CMakeLists.txt:103 (message):
REGRESSIONTEST_PATH invalid. The path needs to contain gmxtest.pl.
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/home/er/Downloads/GromacsDownload/gromacs-2020/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/home/er/Downloads/GromacsDownload/gromacs-2020/build/CMakeFiles/CMakeError.log".
这是我第一次使用GROMACS,Linux,并以这种方式安装软件。因此,尽管我相当有信心我遗漏了一些库(也可能有更多错误)。我不确定如何找到它、安装它,甚至不确定放置它的正确位置。
非常感谢任何有关如何解决这些问题的帮助,或者如果我遵循的指南不正确,如何重新开始并正确安装 GROMACS。
注意:我已经阅读了 GROMACS 网站上的安装指南,但它假设我已经熟悉到一定程度,超出了我的能力范围。
在此先感谢您,如果您需要更多信息,请告诉我。
我不知道什么是 GROMACS,但下面的内容可能会对它有所启发。
Doxygen 原则上不是一个库,而是一个必须安装的程序,所以有一个版本适用于您的平台(虽然可能不是 doxygen 的最新版本,当前版本是 1.9.1)您可以通过 apt-get
调用直接安装它,否则您必须从 https://www.doxygen.nl/download.html or get the sources directly from the repository at https://github.com/doxygen/doxygen 下载源代码。获得源代码后,您可以使用 cmake / make / 安装您的 doxygen 版本并使用它。
我正尝试在 Linux 上为我的硕士项目安装 GROMACS。我已按照本指南中给出的说明进行操作 https://github.com/rehanzfr/MDSimulations/blob/master/README.md,我已经接近最后一步了,运行 行:
sudo cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=OFF -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=OFF -DCMAKE_C_COMPILER=gcc -DREGRESSIONTEST_PATH=/home/username/Downloads/GromacsDownload/regressiontests-2020
然而,我在最后的障碍中倒下了,我得到了错误:
-- Doxygen not found. Documentation targets will not be generated.
CMake Error at tests/CMakeLists.txt:103 (message):
REGRESSIONTEST_PATH invalid. The path needs to contain gmxtest.pl.
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/home/er/Downloads/GromacsDownload/gromacs-2020/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/home/er/Downloads/GromacsDownload/gromacs-2020/build/CMakeFiles/CMakeError.log".
这是我第一次使用GROMACS,Linux,并以这种方式安装软件。因此,尽管我相当有信心我遗漏了一些库(也可能有更多错误)。我不确定如何找到它、安装它,甚至不确定放置它的正确位置。
非常感谢任何有关如何解决这些问题的帮助,或者如果我遵循的指南不正确,如何重新开始并正确安装 GROMACS。
注意:我已经阅读了 GROMACS 网站上的安装指南,但它假设我已经熟悉到一定程度,超出了我的能力范围。
在此先感谢您,如果您需要更多信息,请告诉我。
我不知道什么是 GROMACS,但下面的内容可能会对它有所启发。
Doxygen 原则上不是一个库,而是一个必须安装的程序,所以有一个版本适用于您的平台(虽然可能不是 doxygen 的最新版本,当前版本是 1.9.1)您可以通过 apt-get
调用直接安装它,否则您必须从 https://www.doxygen.nl/download.html or get the sources directly from the repository at https://github.com/doxygen/doxygen 下载源代码。获得源代码后,您可以使用 cmake / make / 安装您的 doxygen 版本并使用它。