ImportError: Spatial indexes require either `rtree` or `pygeos` in geopanda but rtree is installed

Question

我正在尝试在 python 中剪辑空间数据，但是当我运行我的代码时...

europe = gpd.clip(worldmap, europe_bound_gdf)

...我收到错误：

(ImportError: Spatial indexes require either rtreeorpygeos`.)

当我尝试使用以下方式安装 rtree 时：

pip3 install rtree

我被告知：

Requirement already satisfied: rtree in /Users/joshuajones/.pyenv/versions/3.9.4/lib/python3.9/site-packages (0.9.7`)

为什么我的代码不起作用？

Answer 1

我遇到了同样的问题，这为我解决了：

pip uninstall rtree
sudo apt install libspatialindex-dev
pip install rtree

找到答案here。

Answer 2

就我而言，唯一有帮助的是：

安装并导入 condalab，运行两次。

!pip install -q condacolab -q

import condacolab

condacolab.install()

安装 geopandas，这可能需要很长时间

!conda install geopandas

import geopandas as gpd

Answer 3

对我有用，但作为 Mac 用户，我的步骤略有不同：

pip uninstall rtree
brew install spatialindex
pip install rtree

Answer 4

根据文档 here，您可以将 geopandas 设置为使用 pygeos。
注意：只有在更改此值后创建了您使用的 GeoDataFrames（例如，使用 read_file 读取文件）时，它才会起作用。因此，重新导入 geopandas 和运行这两行之后，再次加载 geopandas 数据帧。

import pygeos
geopandas.options.use_pygeos = True

ImportError: Spatial indexes require either `rtree` or `pygeos` in geopanda but rtree is installed

ImportError: Spatial indexes require either `rtree` or `pygeos` in geopanda but rtree is installed

python

gis

geopandas

安装并导入 condalab，运行 两次。

安装 geopandas，这可能需要很长时间

安装并导入 condalab，运行两次。