使用 R 中的 terra 包从不同程度拼接栅格时出错？

Question

我有一个包含大约 191 个 GeoTIFF 文件的文件夹（每个文件都是一个更大区域的不同 DEM（高程）图块）。我想将所有图块合并到一个光栅文件中。我正在使用 terra 包并成功加载每个栅格并将它们从 2 米分辨率聚合到 30 米分辨率。但是，当运行宁 mosaic 函数将它们全部合并时，我运行进入错误（参见下面的错误消息）。我已经能够运行在只有三个图块的较小子集上使用马赛克功能，但是当我扩展到所有文件时，这就成了一个问题。

通过调用栅格汇总（见下文），聚合确实稍微改变了范围 - 这可能是问题所在吗？ resample 可能是一个选项，但每个单独的栅格都有不同的范围，我不确定如何实施此修复。

不确定示例数据集是否有帮助，因为我知道这些函数有效。我运行在高性能集群上运行此代码，因此运行小批量代码效率不高。

library(terra)

files <- as.list(list.files("./DEM_tiles", full.names = TRUE))

raster.list <- lapply(files, rast)
 
for(i in 1:length(raster.list)){
 raster.list[[i]] <- aggregate(raster.list[[i]], fact = 15)
 }

raster.mosaic <- do.call(mosaic, raster.list)

> Error: [mosaic] internal error: extents do not match ()
> Execution halted

下面是两个图块的外观示例：

### Before Aggregation
[[1]]
class       : SpatRaster 
dimensions  : 25000, 25000, 1  (nrow, ncol, nlyr)
resolution  : 2, 2  (x, y)
extent      : -1800000, -1750000, -6e+05, -550000  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
source      : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem.tif 
name        : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem 

[[2]]
class       : SpatRaster 
dimensions  : 25000, 25000, 1  (nrow, ncol, nlyr)
resolution  : 2, 2  (x, y)
extent      : -1800000, -1750000, -550000, -5e+05  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
source      : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem.tif 
name        : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem 


### After Aggregation
[[1]]
class       : SpatRaster 
dimensions  : 1667, 1667, 1  (nrow, ncol, nlyr)
resolution  : 30, 30  (x, y)
extent      : -1800000, -1749990, -600010, -550000  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
source      : memory 
name        : 35_23_1_1_2m_v3.0_reg_dem 
min value   :                 -15.62178 
max value   :                  233.6489 

[[2]]
class       : SpatRaster 
dimensions  : 1667, 1667, 1  (nrow, ncol, nlyr)
resolution  : 30, 30  (x, y)
extent      : -1800000, -1749990, -550010, -5e+05  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
source      : memory 
name        : 35_23_1_2_2m_v3.0_reg_dem 
min value   :                 -15.27713 
max value   :                  243.0772

Answer 1

错误是因为栅格未对齐，并且存在错误。我现在得到

library(terra)
#terra version 1.2.1
crs <- "+proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m"
r1 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -600010, -550000), crs=crs)
r2 <- rast(nrow=1667, ncol=1667, ext=c(-1800000, -1749990, -550010, -5e+05), crs=crs)
values(r1) <- 1:ncell(r1)
values(r2) <- 1:ncell(r2)
m <- mosaic(r1, r2)
#Warning message:
#[mosaic] rasters did not align and were resampled

m
#class       : SpatRaster 
#dimensions  : 3334, 1667, 1  (nrow, ncol, nlyr)
#resolution  : 30, 30  (x, y)
#extent      : -1800000, -1749990, -600010, -499990  (xmin, xmax, ymin, ymax)
#coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
#source      : memory 
#name        :   lyr.1 
#min value   :       1 
#max value   : 2778889

还有

@Elia 的建议是一个很好的解决方法：

r1 <- writeRaster(r1, "test1.tif", overwrite=TRUE)
r2 <- writeRaster(r2, "test2.tif", overwrite=TRUE)
v <- vrt(c("test1.tif", "test2.tif"), "test.vrt", overwrite=TRUE)

v
#class       : SpatRaster 
#dimensions  : 3334, 1667, 1  (nrow, ncol, nlyr)
#resolution  : 30, 30  (x, y)
#extent      : -1800000, -1749990, -600020, -5e+05  (xmin, xmax, ymin, ymax)
#coord. ref. : +proj=stere +lat_0=90 +lat_ts=70 +lon_0=-45 +x_0=0 +y_0=0 +datum=WGS84 +units=m +no_defs 
#source      : test.vrt 
#name        :    test 
#min value   :       1 
#max value   : 2778889

使用 R 中的 terra 包从不同程度拼接栅格时出错？

Error in mosaic of rasters from different extent using terra package in R?

gis

r

raster

spatial

terra