"Incorrect number of dimensions" 在 R 中建立索引时出错
"Incorrect number of dimensions" error when indexing in R
我正在第二次分析我论文的一些结果，因为我有新数据，我使用了 dunntest() 函数并获得了这样的 table：
Comparison Z P.unadj P.adj
1 D20FN30K - D20FN60K -1.7340246 8.291372e-02 1.160792e-01
2 D20FN30K - D20MG30K 1.3602563 1.737488e-01 2.211349e-01
3 D20FN60K - D20MG30K 3.0942809 1.972906e-03 3.068965e-03
然而，当我尝试通过键入 PT[4] 将其编入索引以使其仅具有 P 值时，它给我一个错误，提示“维数不正确”。
我使用的代码与我第一次使用时相同，但现在突然不行了。
我尝试使用 FSA 包中的 dunnTest 函数执行 dunntest，根据我的说法，问题是你的函数的输出不是数据帧或矩阵。
您需要从输出中提取结果数据帧
这里是测试模拟的数据：（来自https://www.rdocumentation.org/packages/FSA/versions/0.8.32/topics/dunnTest）
ponds <- data.frame(pond=as.factor(rep(1:4,each=8)),
pH=c(7.68,7.69,7.70,7.70,7.72,7.73,7.73,7.76,
7.71,7.73,7.74,7.74,7.78,7.78,7.80,7.81,
7.74,7.75,7.77,7.78,7.80,7.81,7.84,NA,
7.71,7.71,7.74,7.79,7.81,7.85,7.87,7.91))
ponds2 <- ponds[complete.cases(ponds),]
如果我 运行 我得到这个测试：
> dunnTest(ponds2$pH,ponds2$pond)
Dunn (1964) Kruskal-Wallis multiple comparison
p-values adjusted with the Holm method.
Comparison Z P.unadj P.adj
1 1 - 2 -2.13700630 0.032597479 0.13038992
2 1 - 3 -2.94934889 0.003184443 0.01592221
3 2 - 3 -0.88480467 0.376261991 1.00000000
4 1 - 4 -2.99180882 0.002773299 0.01663979
5 2 - 4 -0.85480252 0.392660483 0.78532097
6 3 - 4 0.05898698 0.952962480 0.95296248
为了提取 p 值，我这样做了：
a =dunnTest(ponds2$pH,ponds2$pond)
a = a$res
a$P.adj
希望对您有所帮助
我正在第二次分析我论文的一些结果，因为我有新数据，我使用了 dunntest() 函数并获得了这样的 table：
Comparison Z P.unadj P.adj
1 D20FN30K - D20FN60K -1.7340246 8.291372e-02 1.160792e-01
2 D20FN30K - D20MG30K 1.3602563 1.737488e-01 2.211349e-01
3 D20FN60K - D20MG30K 3.0942809 1.972906e-03 3.068965e-03
然而，当我尝试通过键入 PT[4] 将其编入索引以使其仅具有 P 值时，它给我一个错误，提示“维数不正确”。 我使用的代码与我第一次使用时相同，但现在突然不行了。
我尝试使用 FSA 包中的 dunnTest 函数执行 dunntest，根据我的说法，问题是你的函数的输出不是数据帧或矩阵。
您需要从输出中提取结果数据帧
这里是测试模拟的数据：（来自https://www.rdocumentation.org/packages/FSA/versions/0.8.32/topics/dunnTest）
ponds <- data.frame(pond=as.factor(rep(1:4,each=8)),
pH=c(7.68,7.69,7.70,7.70,7.72,7.73,7.73,7.76,
7.71,7.73,7.74,7.74,7.78,7.78,7.80,7.81,
7.74,7.75,7.77,7.78,7.80,7.81,7.84,NA,
7.71,7.71,7.74,7.79,7.81,7.85,7.87,7.91))
ponds2 <- ponds[complete.cases(ponds),]
如果我 运行 我得到这个测试：
> dunnTest(ponds2$pH,ponds2$pond)
Dunn (1964) Kruskal-Wallis multiple comparison
p-values adjusted with the Holm method.
Comparison Z P.unadj P.adj
1 1 - 2 -2.13700630 0.032597479 0.13038992
2 1 - 3 -2.94934889 0.003184443 0.01592221
3 2 - 3 -0.88480467 0.376261991 1.00000000
4 1 - 4 -2.99180882 0.002773299 0.01663979
5 2 - 4 -0.85480252 0.392660483 0.78532097
6 3 - 4 0.05898698 0.952962480 0.95296248
为了提取 p 值，我这样做了：
a =dunnTest(ponds2$pH,ponds2$pond)
a = a$res
a$P.adj
希望对您有所帮助