运行 R 中数据框的自定义函数,按组
Run a custom function on a data frame in R, by group
在获取自定义函数以遍历数据框中的组时遇到一些问题。
这是一些示例数据:
set.seed(42)
tm <- as.numeric(c("1", "2", "3", "3", "2", "1", "2", "3", "1", "1"))
d <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
t <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
h <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
df <- as.data.frame(cbind(tm, d, t, h))
df$p <- rowSums(df[2:4])
我创建了一个自定义函数来计算值 w:
calc <- function(x) {
data <- x
w <- (1.27*sum(data$d) + 1.62*sum(data$t) + 2.10*sum(data$h)) / sum(data$p)
w
}
当我运行整个数据集上的函数时,我得到以下答案:
calc(df)
[1]1.664474
理想情况下,我想要 return 按 tm 分组的结果,例如:
tm w
1 result of calc
2 result of calc
3 result of calc
到目前为止,我已经尝试在我的函数中使用 aggregate
,但出现以下错误:
aggregate(df, by = list(tm), FUN = calc)
Error in data$d : $ operator is invalid for atomic vectors
我觉得我已经盯着这个太久了,有一个明显的答案。如有任何建议,我们将不胜感激。
你可以试试split
:
sapply(split(df, tm), calc)
# 1 2 3
#1.665882 1.504545 1.838000
如果你想要一个列表lapply(split(df, tm), calc)
。
或 data.table
:
library(data.table)
setDT(df)[,calc(.SD),tm]
# tm V1
#1: 1 1.665882
#2: 2 1.504545
#3: 3 1.838000
library(plyr)
ddply(df, .(tm), calc)
使用dplyr
library(dplyr)
df %>%
group_by(tm) %>%
do(data.frame(val=calc(.)))
# tm val
#1 1 1.665882
#2 2 1.504545
#3 3 1.838000
如果我们稍微更改函数以包含多个参数,这也适用于 summarise
calc1 <- function(d1, t1, h1, p1){
(1.27*sum(d1) + 1.62*sum(t1) + 2.10*sum(h1) )/sum(p1) }
df %>%
group_by(tm) %>%
summarise(val=calc1(d, t, h, p))
# tm val
#1 1 1.665882
#2 2 1.504545
#3 3 1.838000
...和地图函数解决方案...
library(purrr)
df %>%
split(.$tm) %>%
map_dbl(calc)
# 1 2 3
# 1.665882 1.504545 1.838000
因为 dplyr 0.8 你可以使用 group_map
:
library(dplyr)
df %>% group_by(tm) %>% group_map(~tibble(w=calc(.)))
#> # A tibble: 3 x 2
#> # Groups: tm [3]
#> tm w
#> <dbl> <dbl>
#> 1 1 1.67
#> 2 2 1.50
#> 3 3 1.84
在获取自定义函数以遍历数据框中的组时遇到一些问题。
这是一些示例数据:
set.seed(42)
tm <- as.numeric(c("1", "2", "3", "3", "2", "1", "2", "3", "1", "1"))
d <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
t <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
h <- as.numeric(sample(0:2, size = 10, replace = TRUE))
df <- as.data.frame(cbind(tm, d, t, h))
df$p <- rowSums(df[2:4])
我创建了一个自定义函数来计算值 w:
calc <- function(x) {
data <- x
w <- (1.27*sum(data$d) + 1.62*sum(data$t) + 2.10*sum(data$h)) / sum(data$p)
w
}
当我运行整个数据集上的函数时,我得到以下答案:
calc(df)
[1]1.664474
理想情况下,我想要 return 按 tm 分组的结果,例如:
tm w
1 result of calc
2 result of calc
3 result of calc
到目前为止,我已经尝试在我的函数中使用 aggregate
,但出现以下错误:
aggregate(df, by = list(tm), FUN = calc)
Error in data$d : $ operator is invalid for atomic vectors
我觉得我已经盯着这个太久了,有一个明显的答案。如有任何建议,我们将不胜感激。
你可以试试split
:
sapply(split(df, tm), calc)
# 1 2 3
#1.665882 1.504545 1.838000
如果你想要一个列表lapply(split(df, tm), calc)
。
或 data.table
:
library(data.table)
setDT(df)[,calc(.SD),tm]
# tm V1
#1: 1 1.665882
#2: 2 1.504545
#3: 3 1.838000
library(plyr)
ddply(df, .(tm), calc)
使用dplyr
library(dplyr)
df %>%
group_by(tm) %>%
do(data.frame(val=calc(.)))
# tm val
#1 1 1.665882
#2 2 1.504545
#3 3 1.838000
如果我们稍微更改函数以包含多个参数,这也适用于 summarise
calc1 <- function(d1, t1, h1, p1){
(1.27*sum(d1) + 1.62*sum(t1) + 2.10*sum(h1) )/sum(p1) }
df %>%
group_by(tm) %>%
summarise(val=calc1(d, t, h, p))
# tm val
#1 1 1.665882
#2 2 1.504545
#3 3 1.838000
...和地图函数解决方案...
library(purrr)
df %>%
split(.$tm) %>%
map_dbl(calc)
# 1 2 3
# 1.665882 1.504545 1.838000
因为 dplyr 0.8 你可以使用 group_map
:
library(dplyr)
df %>% group_by(tm) %>% group_map(~tibble(w=calc(.)))
#> # A tibble: 3 x 2
#> # Groups: tm [3]
#> tm w
#> <dbl> <dbl>
#> 1 1 1.67
#> 2 2 1.50
#> 3 3 1.84