在 Jupyter Notebook 上的 macbook 上安装 rpy2

rpy2 installation on macbook on Jupyter Notebook

正在尝试在终端上安装 rpy2 模块,但没有任何操作。

尝试直接在单元

上安装rpy2
!pip install rpy2
%load_ext rpy2.ipython
%%R -i data 
data <- list('0.47', '-0.36', '-0.5', '0.2', '0.35', '1.82', 
             '-0.78', '-0.91', '0.36', '-1.74', '0.24', '0.76', 
             '0.57', '2.32', '1.55', '-1.31', '-0.09', '-0.02', 
             '-0.07', '-0.19', '-0.25', 
             '-1.09', '0.64', '1.22', '-0.56', '1.76', '0.13', 
             '1.33', '-0.74', '-1.15', '1.63', '1.04', '-0.26', 
             '0.02', '-1.2', '0.37', '0.43', '0.04', '1.34', 
             '0.57', '0.76', '-1.25', '-0.05', '0.12', '0.8', 
             '-0.99', '-0.11', '-0.54', '-0.08', '-0.04', '-0.76', 
             '-0.8', '0.35', '1.54', '-0.99', '-0.35', '-0.28', '0.45', 
             '-0.04', '-0.06', '0.02', '0.58', '-0.32', '-0.1', '0.28', 
             '0.3', '-0.36', '0.81', '0.79', '0.21', '1.81', '0.19', '0.84', 
             '0.2', '-0.06', '-0.11', '-1.4', '-2.08', '0.88', '-0.14',
             '-0.96', '1.3', '0.06', '-0.37', '1.49', '-0.91', 
             '1.14', '-1.05', '1.49', '-0.79', '2.02', '0.38', '2.4', '1.25', 
             '0.5', '1.11', '-0.54', '-0.1', '0.63', '1.01')
num <- as.numeric(unlist(data))
shapiro.test(num)
shapiro.test

结果显示

 File "<ipython-input-3-0be657748cce>", line 20
    num <- as.numeric(unlist(data))
           ^
SyntaxError: invalid syntax

还是不行

我只想将 R 代码附加到我的 Jupyter 笔记本上。

data <- list('0.47', '-0.36', '-0.5', '0.2', '0.35', '1.82', 
             '-0.78', '-0.91', '0.36', '-1.74', '0.24', '0.76', 
             '0.57', '2.32', '1.55', '-1.31', '-0.09', '-0.02', 
             '-0.07', '-0.19', '-0.25', 
             '-1.09', '0.64', '1.22', '-0.56', '1.76', '0.13', 
             '1.33', '-0.74', '-1.15', '1.63', '1.04', '-0.26', 
             '0.02', '-1.2', '0.37', '0.43', '0.04', '1.34', 
             '0.57', '0.76', '-1.25', '-0.05', '0.12', '0.8', 
             '-0.99', '-0.11', '-0.54', '-0.08', '-0.04', '-0.76', 
             '-0.8', '0.35', '1.54', '-0.99', '-0.35', '-0.28', '0.45', 
             '-0.04', '-0.06', '0.02', '0.58', '-0.32', '-0.1', '0.28', 
             '0.3', '-0.36', '0.81', '0.79', '0.21', '1.81', '0.19', '0.84', 
             '0.2', '-0.06', '-0.11', '-1.4', '-2.08', '0.88', '-0.14',
             '-0.96', '1.3', '0.06', '-0.37', '1.49', '-0.91', 
             '1.14', '-1.05', '1.49', '-0.79', '2.02', '0.38', '2.4', '1.25', 
             '0.5', '1.11', '-0.54', '-0.1', '0.63', '1.01')
num <- as.numeric(unlist(data))
shapiro.test(num)
shapiro.test

您的示例仅显示 R 代码,未使用任何 python 函数。

选项 1(简单,没有 jupyter 和 python)

如果您真的不需要 Jupyter 和 python,您可以在 RStudio 中使用 RMarkdon 创建包含 R 代码单元格和文本的文档。

选项 2(困难,使用 jupyter 和 python)

  1. 安装 R 和 python
  2. 安装 Jupyter
  3. 在 jupyter 单元中使用 ! pip install rpy2 安装 rpy2
  4. 运行笔记本中的R代码:
import rpy2
%load_ext rpy2.ipython
%%R -o data 
data <- list(1,2,3)

选项 3(中等,jupyter 只使用 R 而没有 python)

  1. 安装 jupyter
  2. 安装IRkernel
  3. 启动juypter并选择R内核
  4. 在你的 jupyter 单元格中只写 R 代码: