闪亮应用程序中的 RMarkdown

RMarkdown in Shiny Application

问题

有没有办法在闪亮的应用程序中插入(和评估)RMarkdown 脚本。 (请注意,我不是在 RMarkdown 中寻找闪亮的应用程序 here, nor am I looking for Markdown scripts in shiny (see Shiny Gallery Markdown))

我正在构建一个包含文本、方程式、代码块、绘图和交互元素的应用程序。为了方便起见,我将 Markdown 文件用于文本和方程式,并且有时希望在两者之间有一个绘图(即在 RMarkdown 中编写大部分内容)。由于 shiny-app 更复杂(我使用 shinydashboard 包括它的许多独特功能),我更喜欢不使用 first link.

中描述的方法的选项

一个最小的工作示例是:

R 文件:

library(shiny)

ui <- shinyUI(
  fluidPage(
    includeMarkdown("RMarkdownFile.rmd")
  )
)
server <- function(input, output) {}

shinyApp(ui, server)

和"RMarkdownFile.rmd"在同一文件夹中:

This is a text

$$ E(x) = 0 $$ 

```{r, eval = T}
plot(rnorm(100))
```

结果:

目标

我想要的是编织 rmd 文件时的输出:

具体来说,我想要获得代码块的评估(绘制一些东西...),并且我想要获得呈现的数学方程式。

有什么想法吗?

已编辑解决方案

感谢@Bunk 的帮助,我选择了使用命令knit将所有rmd个文件渲染为md个文件,然后将md个文件包含在闪亮的应用程序(我使用降价而不是 html 因为后者产生了一些方程式问题)。最后,includeMarkdown 被包裹在 withMathJax 中以确保方程的正确显示。

最终代码如下所示:

library(shiny)
library(knitr)

rmdfiles <- c("RMarkdownFile.rmd")
sapply(rmdfiles, knit, quiet = T)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        withMathJax(includeMarkdown("RMarkdownFile.md"))
  )
)
server <- function(input, output) { }

shinyApp(ui, server)

我认为编织它并渲染一个 UI 应该可行。

library(shiny)
library(knitr)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        uiOutput('markdown')
  )
)
server <- function(input, output) {
    output$markdown <- renderUI({
        HTML(markdown::markdownToHTML(knit('RMarkdownFile.rmd', quiet = TRUE)))
    })
}

shinyApp(ui, server)

根据@elevendollar 的要求,这就是我最终使用的:

library(shiny)
library(knitr)

rmdfiles <- c("RMarkdownFile.rmd")
sapply(rmdfiles, knit, quiet = T)

ui <- shinyUI(
    fluidPage(
        withMathJax(includeMarkdown("RMarkdownFile.md"))
  )
)
server <- function(input, output) { }

shinyApp(ui, server)